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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000833`

染色体: Chr01 坐标: 17961306-17965999 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000833`
名称	SmilChr01G000833
描述	phytochromobilin:ferredoxin oxidoreductase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17961306 - 17965999 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006824`
GeneID	`131006824`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006824`
原始查询	`SmilChr01G000833`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytochromobilin:ferredoxin oxidoreductase, chloroplastic
产物	phytochromobilin:ferredoxin oxidoreductase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G09150` (HY2) phytochromobilin:ferredoxin oxidoreductase, chloroplast / phytochromobilin synthase (HY2) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820069] identity=51.5; qcov=0.83; evalue=4.09e-83; confidence=high
Rice	`Os01g0949400` (Se13) - identity=60.8; qcov=0.775; evalue=7.41e-88; confidence=high
GO	GO:0010024 (phytochromobilin biosynthetic process); GO:0050619 (phytochromobilin:ferredoxin oxidoreductase activity); GO:0050897 (cobalt ion binding)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05996 (Fe_bilin_red)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006824

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057789966.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057789966.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789966.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789966.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789966.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17961575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:17962501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:17965470`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A11,A25,B105,B127,B129,B15,B17,B2,B30,B34,B57,B66,B77,B89,B94,B98,C13,C29,C30,C7,C73,C8,C83,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789966.1

328 aa

164

328

Fe_bilin_red

PF05996 Fe_bilin_red 54-275 aa

XP_057789967.1

276 aa

138

276

Fe_bilin_red

PF05996 Fe_bilin_red 54-269 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789966.1`	Pfam	`PF05996`	Fe_bilin_red	Domain	54	275	2.3e-57	195.0	Ferredoxin-dependent bilin reductase
`XP_057789967.1`	Pfam	`PF05996`	Fe_bilin_red	Domain	54	269	6.3e-49	167.4	Ferredoxin-dependent bilin reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933983.1
ATCTGTCCGTACAATCCCATCCTTCTATAATCAGAAAGTCCAATTCCTTGGAGCTTCATCGAATGGTATCATCTTACCTCATTCAGAATGATCTCAACTGTCAATAATAATCCCTTACAACCTACGAATACATCTCCCATTAATTTCTCTAGCAGAAAATGGTTCAGTATTAGCAGTAGGATGAGGCCCGCAATGGCCGAAGCAACTTCTTCTCTCACTTACCAGAAATTTGTTCATTTCGCTCTGGAAGAAACCAGAAA...

XM_057933984.1
ATCTGTCCGTACAATCCCATCCTTCTATAATCAGAAAGTCCAATTCCTTGGAGCTTCATCGAATGGTATCATCTTACCTCATTCAGAATGATCTCAACTGTCAATAATAATCCCTTACAACCTACGAATACATCTCCCATTAATTTCTCTAGCAGAAAATGGTTCAGTATTAGCAGTAGGATGAGGCCCGCAATGGCCGAAGCAACTTCTTCTCTCACTTACCAGAAATTTGTTCATTTCGCTCTGGAAGAAACCAGAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006824
ATGATCTCAACTGTCAATAATAATCCCTTACAACCTACGAATACATCTCCCATTAATTTCTCTAGCAGAAAATGGTTCAGTATTAGCAGTAGGATGAGGCCCGCAATGGCCGAAGCAACTTCTTCTCTCACTTACCAGAAATTTGTTCATTTCGCTCTGGAAGAAACCAGAAAGCACACCCACTTAGCCCCTTCTACATTACAGGAAAGATTTGGTTGCTTGTCTTCCATGGATGGGAGAACACAAATTCAAGTGCATTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789966.1
MISTVNNNPLQPTNTSPINFSSRKWFSISSRMRPAMAEATSSLTYQKFVHFALEETRKHTHLAPSTLQERFGCLSSMDGRTQIQVHSFESPKIRLLRSLSIEGSDGMQVLDFAIFPRAEFDLPIFCANFFTTAVINIVVLDLNPLHDVISQQDYKKKYYTHLIPLGLKYGELLPWGGKITAESMKFFSPIVIWTKFPPSEHKHHLLYSAFMDYLKSWLELMDQASGETDVSRIMVNLEAQHKYLTWRAEKDPGHQVLRRL...

XP_057789967.1
MISTVNNNPLQPTNTSPINFSSRKWFSISSRMRPAMAEATSSLTYQKFVHFALEETRKHTHLAPSTLQERFGCLSSMDGRTQIQVHSFESPKIRLLRSLSIEGSDGMQVLDFAIFPRAEFDLPIFCANFFTTAVINIVVLDLNPLHDVISQQDYKKKYYTHLIPLGLKYGELLPWGGKITAESMKFFSPIVIWTKFPPSEHKHHLLYSAFMDYLKSWLELMDQASGETDVSRIMVNLEAQHKYLTWRAEKAKAFSTLKVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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