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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000836`

染色体: Chr01 坐标: 18058335-18060262 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000836`
名称	SmilChr01G000836
描述	scarecrow-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	18058335 - 18060262 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006827`
GeneID	`131006827`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006827`
原始查询	`SmilChr01G000836`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	scarecrow-like protein 3
产物	scarecrow-like protein 3
Arabidopsis	`AT1G50420` (SCL3) scarecrow-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841464] identity=60.2; qcov=0.87; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0948200` (P0466H10.34) - identity=55.5; qcov=0.774; evalue=4.38e-135; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006827

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789968.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789968.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789968.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789968.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789968.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:18058385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C80
`Chr1:18058443`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A18,B110,B124,B16,B6,B8,B88,C22,C67
`Chr1:18058534`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	42	A13,A15,B113,B12,B123,B125,B128,B130,B26,B27,B42,B43,B45,B46,B49,B5,B61,B62,B65,B70,B72,B78,B84,B85,B87,B90,B92,B97,C10,C2,C23,C28,C35,C52,C54,C55,C56,C63,C65,C81,C9,D11
`Chr1:18058578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:18058659`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B44,D10,D11
`Chr1:18058659`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B44,D10,D11
`Chr1:18058676`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A11,A14,A25,B105,B118,B127,B129,B132,B15,B17,B18,B2,B30,B34,B42,B43,B51,B57,B66,B72,B77,B82,B89,B94,B98,C13,C29,C30,C60,C7,C73,C8,C83,D1
`Chr1:18058719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B71
`Chr1:18058719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr1:18058753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:18058814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:18058930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789968.1

552 aa

276

552

GRAS

PF03514 GRAS 157-549 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789968.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	157	549	2.8e-126	422.1	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933985.1
TGATTGGAGAGTCATATCCATAGAAGAGAGAGAAAAATGACAAGTCAAATCCTATATCCCATGAATGCGAACAAATTTGAAGACACTTTTGTCCAAAGTTCAAAAAGTAGAAAGGTGCACACAAATTCCATATTCCTTCCTCCACGACAAACCGCCTTTTCTCTATCCCACTTCCCACCATCCTCGCTTAAGCCTTCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTACACAACAATTTAGGGGAAAACCTCGTCTGTTTCTTTCATTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006827
ATGACAAGTCAAATCCTATATCCCATGAATGCGAACAAATTTGAAGACACTTTTGTCCAAAGTTCAAAAAGTAGAAAGGTGCACACAAATTCCATATTCCTTCCTCCACGACAAACCGCCTTTTCTCTATCCCACTTCCCACCATCCTCGCTTAAGCCTTCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTACACAACAATTTAGGGGAAAACCTCGTCTGTTTCTTTCATTCTCGCACTTATTAGGGCTGCCATTCTCGATTAGATTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789968.1
MTSQILYPMNANKFEDTFVQSSKSRKVHTNSIFLPPRQTAFSLSHFPPSSLKPSSSLSLSTQQFRGKPRLFLSFSHLLGLPFSIRFFDLRILLTEREKKKKRFSLQISYQIPSFLPQMFQEDGSSSVTSSPLQMFPMMTSPHPWLKELKPEERGLCLIQLLVTCAGHVASNNLESANAALDQISHLASPYGDTMQRIASYFSEALADRILRSWPGVYKAFNSTRVPAVAEEIAARRIFFELLPFLKVASVISNQAIVEAM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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