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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000839`

染色体: Chr01 坐标: 18111466-18134147 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000839`
名称	SmilChr01G000839
描述	uncharacterized SmilChr01G000839
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	18111466 - 18134147 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990871`
GeneID	`130990871`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990871`
原始查询	`SmilChr01G000839`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990871

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771100.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057771100.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057771100.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771100.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771100.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:18111489`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr1:18111489`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr1:18133457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	184	A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A21,A22,A24,A25,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B129,B130,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B25,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B45,B48,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B73,B76,B77,B78,B79,B80,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C40,C42,C43,C45,C48,C49,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C65,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C77,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C9,D1,D2,D3,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr1:18133502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A1,B44,C64,C87,D11,D5
`Chr1:18133511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:18133521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:18133529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B29,C5
`Chr1:18133535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B127
`Chr1:18133578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:18133612`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A14,B127,B138,B31,B37,B51,B83,B86,B97,B99,C1,C3,C38
`Chr1:18133660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B44,C64,C87,D5
`Chr1:18133666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771100.1

281 aa

140

281

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 67-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771100.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	67	157	1.4e-05	26.5	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915117.1
ATGAATCTGCCTCTACTTAATGTGATTCGGAATGTTCCAGCGTATGTAAAGTTCTTCAAAGAACTAGCATCAAAGAAAAGGAAATTCGCCGATGATGTGAAAATTGTGGTGTCTGAATTGGCAAGTGCAATATTGCAGCATCAACTTCCACCAAAGCAACGAGATCCAGGAAGCTTTGTTATCAAAATTGCTTTGGGAAATGGAAAGGAGACATCAGGTATGTTGGATTTGGGAGCAGGTATTAATCTAATGCCATTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990871
ATGAATCTGCCTCTACTTAATGTGATTCGGAATGTTCCAGCGTATGTAAAGTTCTTCAAAGAACTAGCATCAAAGAAAAGGAAATTCGCCGATGATGTGAAAATTGTGGTGTCTGAATTGGCAAGTGCAATATTGCAGCATCAACTTCCACCAAAGCAACGAGATCCAGGAAGCTTTGTTATCAAAATTGCTTTGGGAAATGGAAAGGAGACATCAGGTATGTTGGATTTGGGAGCAGGTATTAATCTAATGCCATTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771100.1
MNLPLLNVIRNVPAYVKFFKELASKKRKFADDVKIVVSELASAILQHQLPPKQRDPGSFVIKIALGNGKETSGMLDLGAGINLMPFSLFEQLELGDPTPTRMCLQLADRSVCYPKGIVEYILVKVGGLIIPVDFVVLDVGDVRDNGKEHTLLLGRPFMETTNTLIDVKNGTLKMTVLGETVSFSVRDNSVIPATSLMENCSFVDVIDAAVEMVFLQENSLDIVLANLEALQLSELDELRNEVYDNAKIYKDKFINWYGSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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