当前解析结果
SmilChr01G000840| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000840 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000840 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000840 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 18156130 - 18157572 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991141 |
|---|---|
| GeneID | 130991141 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991141 |
| 原始查询 | SmilChr01G000840 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=29.6; qcov=0.189; evalue=4.84e-08; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991141 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057771249.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057771249.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057771249.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771249.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771249.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:18156156 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr1:18156214 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B1,B57 |
Chr1:18156256 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,C30 |
Chr1:18156281 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr1:18156292 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B73,C30 |
Chr1:18156301 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B73,C30 |
Chr1:18156303 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr1:18156312 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B139,B75,C51,C78,C87 |
Chr1:18156319 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,B48,C34,C35 |
Chr1:18156352 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr1:18156367 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr1:18156376 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B40,B94,C32,C87 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。