当前解析结果
SmilChr01G000850| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000850 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000850 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000850 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 18377903 - 18379460 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006836 |
|---|---|
| GeneID | 131006836 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006836 |
| 原始查询 | SmilChr01G000850 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0804400; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os02g0804400; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G15900 (AT3G15900)homoserine O-acetyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820833] identity=53.9; qcov=0.551; evalue=7.14e-16; confidence=low |
| Rice | Os02g0804400- identity=55.2; qcov=0.492; evalue=3.27e-16; confidence=low |
| GO | GO:0009507 (chloroplast) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006836 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057789982.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057789982.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 1.00000 | XP_057789982.1 |
| 4 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.40000 | XP_057789982.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789982.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:18378609 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 68 | A15,A19,A21,A4,B101,B110,B120,B122,B125,B126,B131,B132,B134,B135,B136,B139,B15,B18,B19,B22,B25,B26,B27,B32,B33,B36,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B48,B50,B52,B56,B57,B59,B66,B70,B86,B87,B9,B90,B92,B96,B99,C15,C16,C18,C19,C20,C28,C3,C35,C36,C47,C50,C52,C54,C6,C74,C76,C78,C8,C82,D2,D8 |
Chr1:18378617 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B8,B80,C31 |
Chr1:18379232 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。