当前解析结果
SmilChr01G000861| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000861 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000861 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000861 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 18525937 - 18527077 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991857 |
|---|---|
| GeneID | 130991857 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991857 |
| 原始查询 | SmilChr01G000861 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=33.3; qcov=0.351; evalue=2.88e-10; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991857 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057772301.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057772301.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057772301.1 |
| 4 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057772301.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772301.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:18525951 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,B52 |
Chr1:18525979 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B105,B13,B59 |
Chr1:18525990 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B124,B134,B140 |
Chr1:18525993 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B138,B44,B87,C36,C75 |
Chr1:18526006 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 11 | A4,B134,B14,B15,B27,B43,B48,B94,C76,C9,D5 |
Chr1:18526009 |
G |
GTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 13 | A20,B103,B113,B123,B128,B138,B26,B28,B60,B73,C15,C31,C50 |
Chr1:18526010 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | A20,A4,B14,B87 |
Chr1:18526010 |
GA |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | A20,A4,B14,B87 |
Chr1:18526044 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,B26 |
Chr1:18526070 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
Chr1:18526075 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B28,B60,C60 |
Chr1:18526086 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。