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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000879`

染色体: Chr01 坐标: 18680179-18681956 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000879`
名称	SmilChr01G000879
描述	two-component response regulator-like APRR2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	18680179 - 18681956 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006860`
GeneID	`131006860`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006860`
原始查询	`SmilChr01G000879`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator-like APRR2
产物	two-component response regulator-like APRR2
Arabidopsis	`AT3G16857` (RR1) response regulator 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820940] identity=54.4; qcov=0.311; evalue=1.33e-13; confidence=low
Rice	`Os08g0346500` (P0410E11.135) - identity=56.4; qcov=0.251; evalue=1.62e-13; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006860

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789995.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789995.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789995.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789995.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789995.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:18680308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:18680326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A14,A9,B10,B115,B128,B133,B20,B21,B35,B51,B69,B73,B91,B93,B98,C19,C20,C36,C39,C47,C49,C57,C85,D6
`Chr1:18680449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,B79,C86,D5
`Chr1:18680463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B68,B82,C85
`Chr1:18680476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C48
`Chr1:18680520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B71
`Chr1:18680522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B71
`Chr1:18680562`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C19,C82
`Chr1:18680562`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C19,C82
`Chr1:18680627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B103
`Chr1:18681469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C48
`Chr1:18681472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789995.1

219 aa

110

219

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 56-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789995.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	56	103	3.2e-07	31.1	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934012.1
TTGGAAGTTGGAGCATTATTATGCATAAAAAAGCCCATCACAGAGGAAATAGCAAGGTACCTATGGCAGCTCGTGGTAACGCGCAAAAGAAAGAAAAACGAGTTGAATATGGCATCCAATATTTATAATAATATTGGAGTTGGGGAATTCAAATTCAATGATATTATAAGCGAAAATGCTAATTCAGAGGAAAGTCATAACAACATAAAAATAAAATGTGAAAATGATGTTGATCATCAAGAAATTGTTAGCATAAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006860
ATGGCATCCAATATTTATAATAATATTGGAGTTGGGGAATTCAAATTCAATGATATTATAAGCGAAAATGCTAATTCAGAGGAAAGTCATAACAACATAAAAATAAAATGTGAAAATGATGTTGATCATCAAGAAATTGTTAGCATAAGAAGCAAGGTTTGGACCGAGTGGACTCAGGAACTTCATGATAAGTTCATGTTTGCCGTCAGACAGCTTGGACCAGGAAGATGTTATCCAAAAGATATTCTCGAGGTAATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789995.1
MASNIYNNIGVGEFKFNDIISENANSEESHNNIKIKCENDVDHQEIVSIRSKVWTEWTQELHDKFMFAVRQLGPGRCYPKDILEVMNVPGLTRMQVASHLQKCRIGSWTPPNERTKRLCLGLHHITPNAQNNMEALESKASSIPFPFDASSYYNQTHYLEFPSIDSVTQSFCAHEEVPINYNETFMNNANVEKCWENTSKTGDDDVGKAQVVGKNNEEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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