当前解析结果
SmilChr01G000883| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000883 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000883 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000883 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 18799318 - 18799794 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992836 |
|---|---|
| GeneID | 130992836 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992836 |
| 原始查询 | SmilChr01G000883 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992836 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057773608.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057773608.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773608.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773608.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773608.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:18799322 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A21,B12,B131,B58,C11,C66,C72,C79,C87 |
Chr1:18799326 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | A21,B131,B58,C11,C66,C72,C87 |
Chr1:18799347 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B38,C33,C46 |
Chr1:18799368 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B34 |
Chr1:18799371 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,B58,C72 |
Chr1:18799377 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,B58 |
Chr1:18799380 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,B58 |
Chr1:18799383 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B12 |
Chr1:18799420 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B34 |
Chr1:18799521 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B99 |
Chr1:18799554 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr1:18799739 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B53,B83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。