Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G000884

染色体: Chr01 坐标: 18818467-18819080 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G000884
名称SmilChr01G000884
描述uncharacterized SmilChr01G000884
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向18818467 - 18819080 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130992939
GeneID130992939
locus_tag-
NCBI NameLOC130992939
原始查询SmilChr01G000884

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述Signal transduction histidine kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819356]; symbol=CKI1; hit=AT2G47430; species=arabidopsis; confidence=low
产物Signal transduction histidine kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819356]; symbol=CKI1; hit=AT2G47430; species=arabidopsis; confidence=low
ArabidopsisAT2G47430 (CKI1)
Signal transduction histidine kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819356]
identity=32.4; qcov=0.915; evalue=1.33e-12; confidence=low
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130992939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Endoplasmic reticulum 内质网 1.00000 XP_057773669.1
2 Endoplasmic reticulum membrane 内质网膜 0.80000 XP_057773669.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057773669.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057773669.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057773669.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057917686.1
GAACACTCGAAATTAAGAAGATATTGTTTCAAGAAAGAAGCATTTGAAGTTGTTGATTTTGTAAGATGAAGCAACATTCCTGGATTGTGTTGCGTCCCGTTTGTTTCTTCGTTTTCCTGATACTTGTGGTGTTGTGTTTGGCTGCTCTGTTGATCACGATATGGTTCAACAAGGTCGCATCAATCGAAAAGGAAGTGAAGTTGATAGCACACAGCAGCCATCAACATTTTATATCTGAAATTCACAATGCAGCTGCCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130992939
ATGAAGCAACATTCCTGGATTGTGTTGCGTCCCGTTTGTTTCTTCGTTTTCCTGATACTTGTGGTGTTGTGTTTGGCTGCTCTGTTGATCACGATATGGTTCAACAAGGTCGCATCAATCGAAAAGGAAGTGAAGTTGATAGCACACAGCAGCCATCAACATTTTATATCTGAAATTCACAATGCAGCTGCCTTCTTCTCTCCCAACAATGCTTCAGCCATCAACTTTGCCCGAATTTTGAGTTTCTCTTTGGATAATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057773669.1
MKQHSWIVLRPVCFFVFLILVVLCLAALLITIWFNKVASIEKEVKLIAHSSHQHFISEIHNAAAFFSPNNASAINFARILSFSLDNNNDLHFPNIESKVVPALFQAFSTIPYLSQIIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器