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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000897`

染色体: Chr01 坐标: 19056649-19058109 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000897`
名称	SmilChr01G000897
描述	uncharacterized SmilChr01G000897
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19056649 - 19058109 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006876`
GeneID	`131006876`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006876`
原始查询	`SmilChr01G000897`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=34.1; qcov=1.05; evalue=8.98e-38; confidence=low
Rice	`Os03g0643050` - identity=44.4; qcov=1.04; evalue=1.5e-58; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006876

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790008.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057790008.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057790008.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790008.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790008.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19056709`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B134,B21,B69,B87,C16,C77,D2,D6,D9
`Chr1:19056715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr1:19056752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B13,B24,C36,D10
`Chr1:19056772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	172	A1,A10,A13,A15,A16,A19,A20,A21,A23,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B111,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B17,B18,B20,B21,B23,B24,B25,B27,B30,B31,B32,B34,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B6,B61,B63,B65,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B78,B79,B8,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B97,C1,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C2,C20,C21,C23,C25,C27,C3,C31,C32,C33,C36,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C65,C66,C67,C69,C70,C72,C74,C75,C76,C8,C80,C82,C83,C84,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr1:19056803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B121,B123,B13,B18,B33,B34,B52,B86,C14,C38,C39,C72
`Chr1:19056814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B61,C12
`Chr1:19056818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A24,B71,C22
`Chr1:19056846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B137,B67,C79
`Chr1:19056850`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A14,A24,B71,C22
`Chr1:19056850`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A14,A24,B71,C22
`Chr1:19056852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B67
`Chr1:19057035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790008.1

215 aa

108

215

DDE_Tnp_4

Plant_tran

PF13359 DDE_Tnp_4 6-154 aa PF04827 Plant_tran 98-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790008.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	6	154	3.5e-20	72.9	DDE superfamily endonuclease
`XP_057790008.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	98	157	9.2e-07	29.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934025.1
TAGGGCTGCTTGGGGGCGCTAGATGCCACCTATATTGATGTGATGGTGCCAACGAAGGATAGGCCACGCTACAGGACGCGTAAGGGGCAGATCGCAACCAATACACTAGCAGTGTGCGATCGTCAAATGCAATTCGTGTATGTTCTCCCTGGTTGGGAGGGTTCCGCCGCCGATTCAAGGGTACTCCGCGATGCACTCACGAGGGTACATGGGTTTAGAGTGCCAAGAGGAAACTACTACTTGTGCGACAACGGCTACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006876
ATGGTGCCAACGAAGGATAGGCCACGCTACAGGACGCGTAAGGGGCAGATCGCAACCAATACACTAGCAGTGTGCGATCGTCAAATGCAATTCGTGTATGTTCTCCCTGGTTGGGAGGGTTCCGCCGCCGATTCAAGGGTACTCCGCGATGCACTCACGAGGGTACATGGGTTTAGAGTGCCAAGAGGAAACTACTACTTGTGCGACAACGGCTACGCTAACTGTGACGGCTTTTTGGCACCCTACAAAGGCGTGAGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790008.1
MVPTKDRPRYRTRKGQIATNTLAVCDRQMQFVYVLPGWEGSAADSRVLRDALTRVHGFRVPRGNYYLCDNGYANCDGFLAPYKGVRYHLKEWGPLAGRPQNARELFNLCHAKARNAIKRAFGVMKMRWAIFRSSSYYPVKVLNRLIMACFVLHNFIRSNMVVDPIEQQFDNQAAEMENMDLEGGEYVDGVEPSPAWTAARDDLAQQMWQQYIEMP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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