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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000899`

染色体: Chr01 坐标: 19060158-19062455 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000899`
名称	SmilChr01G000899
描述	uncharacterized SmilChr01G000899
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19060158 - 19062455 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006877`
GeneID	`131006877`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006877`
原始查询	`SmilChr01G000899`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834593]; symbol=AT5G45570; hit=AT5G45570; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834593]; symbol=AT5G45570; hit=AT5G45570; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G45570` (AT5G45570) Ulp1 protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834593] identity=27.2; qcov=0.232; evalue=6.87e-08; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016926 (protein desumoylation); GO:0016929 (deSUMOylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006877

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790009.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057790009.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057790009.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790009.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790009.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19060200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr1:19060228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B136
`Chr1:19060290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B62
`Chr1:19060297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B51,B58,B84,C26
`Chr1:19060334`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A6,B1,B106,B113,B119,B122,B125,B129,B140,B16,B18,B2,B25,B34,B42,B43,B6,B64,B71,B72,B73,B90,B92,C20,C22,C24,C27,C4,C42,C67,C70,C78,D5,D8
`Chr1:19060345`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	B1,B101,B106,B107,B113,B119,B122,B133,B16,B18,B25,B34,B42,B43,B6,B64,B71,B72,B73,B90,B92,C20,C22,C24,C25,C27,C4,C42,C47,C67,C70,C78,C86,D5,D8
`Chr1:19060350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:19060390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:19060484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B78,C43
`Chr1:19060492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A10,A23,B127,B128,B140,B15,B19,B24,B27,B29,B32,B37,B4,B40,B41,B51,B54,B63,B75,B77,B81,B98,C16,C23,C4,C46,C51,C54,C76,C82,C9,D3,D7
`Chr1:19060495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B13
`Chr1:19060596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790009.1

587 aa

294

587

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 462-581 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790009.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	462	581	1.5e-13	51.9	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934026.1
AATTATTTTATCTCCGAAGGAATATGAATTGATGGATGAGCTCGGTATTCCTTCATCGATGCATCCCGCTGCACCTACTCCAGTTTTTAACTCAAAGACCTTTCCGAGAAAAAGACGTTTGACATACGAGGACGTTGAGGATGTTGGAAAAAGTGCAGCAATGAAGGAAAGTCCAGCAATGAAGGAAAGTCCGCGGCGTTCTAGTCGTTTGATTGGGAAATCCGGGGGAATCGAAAGAAAGAAGGACAATCATTTGGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006877
ATGGATGAGCTCGGTATTCCTTCATCGATGCATCCCGCTGCACCTACTCCAGTTTTTAACTCAAAGACCTTTCCGAGAAAAAGACGTTTGACATACGAGGACGTTGAGGATGTTGGAAAAAGTGCAGCAATGAAGGAAAGTCCAGCAATGAAGGAAAGTCCGCGGCGTTCTAGTCGTTTGATTGGGAAATCCGGGGGAATCGAAAGAAAGAAGGACAATCATTTGGATGATGTTGCAGAAAATACACCAGCTACTCCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790009.1
MDELGIPSSMHPAAPTPVFNSKTFPRKRRLTYEDVEDVGKSAAMKESPAMKESPRRSSRLIGKSGGIERKKDNHLDDVAENTPATPALSKSTVKTHNLAAIQENANTNSNAFVRLLMEMMEKLDKLSQKLDKIDVKVDHRDATLHEVVLACIRGYFEKKASSHPGRFTGEKNSPLQKTDEHKSNVNVVAGLCESSTFQNLDDPFLGKKGDQHKVSNTEWFSTEWLLQDPLLIDDINYQQRLKPVPLTDNPMKKSLFGDDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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