当前解析结果
SmilChr01G000903| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000903 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000903 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000903 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 19085731 - 19086400 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993257 |
|---|---|
| GeneID | 130993257 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993257 |
| 原始查询 | SmilChr01G000903 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993257 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057774101.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774101.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774101.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057774101.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057774101.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:19085781 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,A3,A4,B132,C23 |
Chr1:19085796 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 126 | A11,A14,A15,A16,A25,A3,A4,A5,A6,A7,B101,B102,B104,B106,B107,B108,B111,B112,B113,B117,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B13,B131,B132,B133,B135,B139,B14,B140,B16,B17,B19,B20,B21,B23,B24,B25,B28,B29,B30,B31,B37,B39,B42,B43,B44,B48,B53,B54,B56,B57,B58,B60,B63,B65,B66,B69,B71,B72,B74,B75,B77,B78,B79,B84,B88,B9,B90,B93,B94,B95,C11,C15,C17,C19,C2,C21,C23,C24,C25,C26,C28,C31,C33,C34,C40,C43,C44,C45,C49,C5,C51,C54,C56,C58,C59,C61,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C72,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C81,C83,C85,C86,D1,D2,D3,D5,D6,D9 |
Chr1:19085837 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B119,B132,C23,C31 |
Chr1:19085864 |
T |
TCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 33 | A1,A13,A14,A16,B101,B108,B109,B113,B124,B128,B136,B17,B31,B34,B52,B7,B79,B80,B89,B9,B91,B93,C17,C2,C20,C38,C46,C55,C76,C78,C82,C83,D11 |
Chr1:19085867 |
T |
TCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 34 | A1,A13,A14,A16,B101,B108,B109,B113,B124,B128,B136,B17,B31,B34,B52,B7,B79,B80,B89,B9,B91,B93,C14,C17,C2,C20,C38,C46,C55,C76,C78,C82,C83,D11 |
Chr1:19085889 |
GTA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D11 |
Chr1:19085889 |
GTA |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:19085904 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:19085908 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:19085930 |
TAC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A22,B120,B130,B40,B58,B84,B90,C28,C41,C43,D10 |
Chr1:19086096 |
TAA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B104 |
Chr1:19086096 |
TAA |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。