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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000904`

染色体: Chr01 坐标: 19086795-19090554 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000904`
名称	SmilChr01G000904
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19086795 - 19090554 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993338`
GeneID	`130993338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993338`
原始查询	`SmilChr01G000904`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=31.1; qcov=0.773; evalue=2.89e-96; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=35.3; qcov=0.793; evalue=3.69e-126; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774200.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774200.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774200.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774200.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774200.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19086811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C83
`Chr1:19086860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B8,B86,B93,C20,C6
`Chr1:19086899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A13,B103,B134,B137,B16,B22,B29,B31,B36,B49,B79,B81,B86,C13,C24,C25,C30,C31,C35,C42,C49,C5,C55,C57,C6,C60,C75
`Chr1:19086904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C4
`Chr1:19086919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr1:19086925`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A10,A13,B100,B129,B130,B14,B140,B2,B29,B33,B36,B41,B45,B68,B71,B9,B91,C12,C13,C25,C45,C60,C61,C7,D8,D9
`Chr1:19086927`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	145	A10,A13,A19,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A8,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B104,B110,B112,B113,B117,B118,B120,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B134,B136,B137,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B24,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B4,B41,B44,B45,B49,B5,B52,B56,B58,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B75,B77,B8,B81,B82,B83,B84,B86,B89,B9,B94,B95,B97,B98,B99,C10,C12,C13,C15,C16,C18,C19,C21,C24,C25,C26,C28,C3,C30,C31,C34,C35,C36,C39,C4,C40,C41,C42,C45,C48,C49,C5,C50,C51,C54,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C83,C84,D10,D11,D8,D9
`Chr1:19087062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:19087066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B84,C62
`Chr1:19088468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B129,B2
`Chr1:19088496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,C29,D1,D9
`Chr1:19088498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774200.1

765 aa

382

765

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

SWIM

PF03101 FAR1 68-156 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 250-347 aa PF10551 MULE 279-373 aa PF04434 SWIM 571-590 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774200.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	68	156	4.3e-18	66.5	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057774200.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	250	347	9.4e-07	29.5	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057774200.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	279	373	1.4e-24	87.0	MULE transposase domain
`XP_057774200.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	571	590	7.7e-07	29.2	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918217.1
ATGGTTATCGACTTGAATGTTTCTGATGATGGCTTTGAAGAAGAAGAAAATGAGAATAATTTTGATGGTAATGAATGTAGCTTGTCTGAAGATGTTAGTGTTTCAGATTTGGAGAGCGAGTCAGATAAGTCACTAAGAATTGAAAATGAGGATAAATTGCAGGTTGGTGCTGTTTATGATAGTTTGGATGTGATTTATATTTTGTACACCCAATATGGTATTTTATCTGGATTCAGTGTTAGGAAGGGGTCCAATAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993338
ATGGTTATCGACTTGAATGTTTCTGATGATGGCTTTGAAGAAGAAGAAAATGAGAATAATTTTGATGGTAATGAATGTAGCTTGTCTGAAGATGTTAGTGTTTCAGATTTGGAGAGCGAGTCAGATAAGTCACTAAGAATTGAAAATGAGGATAAATTGCAGGTTGGTGCTGTTTATGATAGTTTGGATGTGATTTATATTTTGTACACCCAATATGGTATTTTATCTGGATTCAGTGTTAGGAAGGGGTCCAATAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774200.1
MVIDLNVSDDGFEEEENENNFDGNECSLSEDVSVSDLESESDKSLRIENEDKLQVGAVYDSLDVIYILYTQYGILSGFSVRKGSNKKFDNSDILRLKVYLCSCEGYPDNKRSVGRIASYKKQVSRTNCKARLRVVREEDGPWRVSVFFKQHNHELVSPDQSYTLRSARHMSFAKKSVLDAFRAAGIQISRAYRFMEKEAGGRANVGFMKKDAYAHVNLMKKETKLENGDANALMKYLIGKGNTETHFYWNVQLDDDGRLI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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