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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000906`

染色体: Chr01 坐标: 19139124-19141242 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000906`
名称	SmilChr01G000906
描述	stress-response A/B barrel domain-containing protein HS1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19139124 - 19141242 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006882`
GeneID	`131006882`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006882`
原始查询	`SmilChr01G000906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stress-response A/B barrel domain-containing protein HS1-like
产物	stress-response A/B barrel domain-containing protein HS1-like
Arabidopsis	`AT3G17210` (HS1) heat stable protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820980] identity=49.1; qcov=0.991; evalue=2.83e-36; confidence=medium
Rice	`Os01g0516600` (B1108H10.11-1) - identity=53.5; qcov=0.927; evalue=8.81e-36; confidence=medium
GO	GO:0009865 (pollen tube adhesion)
KEGG	-
Pfam	PF07876 (Dabb)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006882

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790013.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790013.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790013.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790013.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790013.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19139213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C10
`Chr1:19139285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:19139340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:19139382`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A10,B118,B136,B33,B71,C13,C45,C60,C61,C9,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790013.1

109 aa

109

Dabb

PF07876 Dabb 9-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790013.1`	Pfam	`PF07876`	Dabb	Domain	9	103	3.9e-24	85.8	Stress responsive A/B Barrel Domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934030.1
AACTAGCTAGAAAACTACTTCTTTCTAACTCCACATGTGGGATTTAAATAATACAACTATTTGAAGCTGTATACTATAATGACAGTTGCAAGTTGCACCATACCCCCAATATAACAAATATTTCTAGCTTCTACGGATATCTGGGAGAGAGAGATGGAGGATTGCAAGAGAGAAGCAAAGCATATATTTCTTGCAAAGTTCAAAGAAGGAGTAACTGAGGAGCAAATTGAAGAATGCATCAAACGGTTAATCAGCCTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006882
ATGGAGGATTGCAAGAGAGAAGCAAAGCATATATTTCTTGCAAAGTTCAAAGAAGGAGTAACTGAGGAGCAAATTGAAGAATGCATCAAACGGTTAATCAGCCTTGTTGATCTTTTTCCTTCACTCAAGGCCTTCAATTGGGGTAAAGAGATGGGCATTGCAAACTTTCATCAAGGTTTCACTCATGTCTTTGAATCAACATTTGAAAGTGCGGAAGGTCTTGCTGGGTTTATGTCTCATCCGCATCATCACGATTATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790013.1
MEDCKREAKHIFLAKFKEGVTEEQIEECIKRLISLVDLFPSLKAFNWGKEMGIANFHQGFTHVFESTFESAEGLAGFMSHPHHHDYANFLLPQLEKFVAFDFQPTKVQP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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