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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000912`

染色体: Chr01 坐标: 19343289-19350205 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000912`
名称	SmilChr01G000912
描述	cytochrome P450 CYP72A219-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19343289 - 19350205 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006893`
GeneID	`131006893`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006893`
原始查询	`SmilChr01G000912`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome P450 CYP72A219-like
产物	cytochrome P450 CYP72A219-like
Arabidopsis	`AT3G14610` (CYP72A7) cytochrome P450, family 72, subfamily A, polypeptide 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820689] identity=61.3; qcov=1.01; evalue=3.36e-171; confidence=high
Rice	`Os01g0602400` (OsCYP72A32) - identity=57.7; qcov=0.99; evalue=6.49e-169; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006893

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057790022.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057790022.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790022.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790022.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19347510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr1:19348509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,A4,B103,B63
`Chr1:19348555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:19348902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:19348926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:19349206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:19349365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:19349368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:19349438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B126,B25,B94,C80
`Chr1:19349503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,C9
`Chr1:19349610`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C64,C66
`Chr1:19349610`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790022.1

516 aa

258

516

p450

PF00067 p450 84-492 aa

XP_057790023.1

458 aa

229

458

p450

PF00067 p450 26-434 aa

XP_057790024.1

385 aa

192

385

p450

PF00067 p450 7-361 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790022.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	84	492	2.8e-81	274.4	Cytochrome P450
`XP_057790023.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	26	434	1.9e-81	274.9	Cytochrome P450
`XP_057790024.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	7	361	8.4e-75	253.0	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934040.1
TTTCTCCTCACTACCGTCTGTCTGCCGCGCTCACTTTCGTTCTTGTTCTCTCTCTGCCGTCGCCGCCGCCGCCACACGCGCCTCCTCAGGTAGCTCGTGGCCACGGCCTCGCCGCCTCGGACCTCTCCGTCAAGCGCTGCAACCTGCAAGCGCCAAGCAGGCAGCACAACAGCAGTGCGCCTCCCAGCCCCGTCTCCTTCGATCGACAGCAGCAGTGCGCGACTGCGCCGCACCGCCGCCCTCACCTAGCCTTCCCCGTC...

XM_057934041.1
TACTGTTGAAAGATAAATACTCCCCAGGAAACCTATGTTTTGCAGTTCTAGTGCAGAGAAGCGGAAGATTCTGATGCAAATACCTCTCTTTCACCCGTCGTTTGATCATATGAACAACATTTCCAGTCTGTGGAAATGAGTCGTTTATTTGGTCTGGGCCAAGGCCTTGCATTATCCTGACTGATCCGGAGCTAGTTAAGGAGGTTCTGACCAAGAGCTATCTGTACCTAAAGCCGGAGAACACGAATCCGATGACGAAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131006893
ATGGAAGTTGCGTTTCAAATATTTGCGTCTGCTTTGGCGTTGGCAGCGTTGATATTCACATGGAAATTACTGAATTGGGCCTACTTCACGCCGAAGAGGCTGGGAGAAGCCCTCACTAAGCAAGGGTTTAAAGGTAATTCCTACAAATTGGTGTATGGCGACTTGAAAGAACTGATGCAGTTGAACATGGAAGCCAGGAACAAGCCCATCAATCTTGATGATGATATCAAGAATAGAGTTGCGCCTTTTCTCGTCAACAC...

LOC131006893
ATGCAGTTGAACATGGAAGCCAGGAACAAGCCCATCAATCTTGATGATGATATCAAGAATAGAGTTGCGCCTTTTCTCGTCAACACTATTCACAAGCATGGAAATGAGTCGTTTATTTGGTCTGGGCCAAGGCCTTGCATTATCCTGACTGATCCGGAGCTAGTTAAGGAGGTTCTGACCAAGAGCTATCTGTACCTAAAGCCGGAGAACACGAATCCGATGACGAAGCTGCTTGCACAAGGACTTGTGAGCTATGAGAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057790022.1
MEVAFQIFASALALAALIFTWKLLNWAYFTPKRLGEALTKQGFKGNSYKLVYGDLKELMQLNMEARNKPINLDDDIKNRVAPFLVNTIHKHGNESFIWSGPRPCIILTDPELVKEVLTKSYLYLKPENTNPMTKLLAQGLVSYEKDEWAKHRKIINPAFHLDKLKLMIPAFYLSCDEVLKSWEKNVSSEGSYEVDVWPYLKNLTSDAISRTAFGSSYREGRRIFELQREQVEHIMQAAPIYVPGWRFVPTKRHRRMKQVE...

XP_057790023.1
MQLNMEARNKPINLDDDIKNRVAPFLVNTIHKHGNESFIWSGPRPCIILTDPELVKEVLTKSYLYLKPENTNPMTKLLAQGLVSYEKDEWAKHRKIINPAFHLDKLKLMIPAFYLSCDEVLKSWEKNVSSEGSYEVDVWPYLKNLTSDAISRTAFGSSYREGRRIFELQREQVEHIMQAAPIYVPGWRFVPTKRHRRMKQVEREVQSTIRGLISKRMEAMKTGEARHDEDLLSILLASNSQEIEESGNKSSGMTIDAVVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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