当前解析结果
SmilChr01G000913| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000913 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000913 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000913 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 19345960 - 19346615 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006900 |
|---|---|
| GeneID | 131006900 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006900 |
| 原始查询 | SmilChr01G000913 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830786]; symbol=AT5G09270; hit=AT5G09270; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830786]; symbol=AT5G09270; hit=AT5G09270; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G09270 (AT5G09270)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830786] identity=54.6; qcov=0.815; evalue=2.97e-30; confidence=medium |
| Rice | Os01g0861000- identity=69.5; qcov=0.496; evalue=2.74e-24; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006900 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057790032.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057790032.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.20000 | XP_057790032.1 |
| 4 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.20000 | XP_057790032.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057790032.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:19345964 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C19,C82 |
Chr1:19345991 |
C |
CTT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 30 | A21,A23,A7,B105,B106,B107,B109,B117,B125,B2,B37,B65,B67,B68,B69,B76,B81,B90,B91,B92,B95,C14,C17,C29,C34,C4,C41,C42,C48,D11 |
Chr1:19346188 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr1:19346258 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。