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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000925`

染色体: Chr01 坐标: 19590326-19605730 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000925`
名称	SmilChr01G000925
描述	uncharacterized SmilChr01G000925
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19590326 - 19605730 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993865`
GeneID	`130993865`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993865`
原始查询	`SmilChr01G000925`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=38; qcov=0.775; evalue=1.19e-45; confidence=medium
Rice	`Os03g0643050` - identity=42.9; qcov=0.731; evalue=9.88e-63; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993865

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774908.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057774908.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774908.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774908.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774908.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19590342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:19590415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr1:19590415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:19590442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:19590449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C80
`Chr1:19590484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:19590490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:19590513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr1:19590580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:19590604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C63,C67
`Chr1:19590604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C67
`Chr1:19590645`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A15,A22,A5,A6,A9,B103,B111,B118,B123,B135,B139,B14,B31,B5,B54,B65,B67,B70,B77,C18,C21,C39,C40,C55,C75,C76,C80,C84,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774908.1

316 aa

158

316

DDE_Tnp_1

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF01609 DDE_Tnp_1 92-258 aa PF04827 Plant_tran 92-263 aa PF13359 DDE_Tnp_4 102-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774908.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	92	258	6.3e-10	39.9	Transposase DDE domain
`XP_057774908.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	92	263	4.6e-08	33.6	Plant transposon protein
`XP_057774908.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	102	260	1.2e-24	87.5	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918925.1
ATGCCGGAGGGGGCGGCGGCACGAAAACCTCTCGACGGCGTCGCGGTGGAAGGGATGGCAGCGGAACACTGGGGGTTGATTCTGGTGGTGGACGTCGATGGGTGTAGAGGGGCAAATCGAACAGGACTCCTACTGTCGGAGCTAGGAAGCGGCGTCGGCGACTGGATACTGCTGCTGCTGCTACTGCGCGGAGGCGACTCGAGACTGCTGCTGCGCGGCTGCGCAGTGCCAGATCCTGTACCAGATGATTGTACGGATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993865
ATGCCGGAGGGGGCGGCGGCACGAAAACCTCTCGACGGCGTCGCGGTGGAAGGGATGGCAGCGGAACACTGGGGGTTGATTCTGGTGGTGGACGTCGATGGGTGTAGAGGGGCAAATCGAACAGGACTCCTACTGTCGGAGCTAGGAAGCGGCGTCGGCGACTGGATACTGCTGCTGCTGCTACTGCGCGGAGGCGACTCGAGACTGCTGCTGCGCGGCTGCGCAGTGCCAGATCCTGTACCAGATGATTGTACGGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774908.1
MPEGAAARKPLDGVAVEGMAAEHWGLILVVDVDGCRGANRTGLLLSELGSGVGDWILLLLLLRGGDSRLLLRGCAVPDPVPDDCTDSRWKWFKGCLGALDDTYINVTVPLLDKPRYRTRKGHICTNALAVCDRNLRFVYVLSGWEGSASDSRVLRDAVNRVNGLKVPRGNYYLCDNEYTNSEGFLTPYKGVRYHLKEWGPDNRRPENAREMFNMRHTKARNVIERAFGILKMRWGILRSATYYPIKVQNRLIMACFLLHN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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