当前解析结果
SmilChr01G000927| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000927 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000927 |
| 描述 | basic leucine zipper 23-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 19658453 - 19659933 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006899 |
|---|---|
| GeneID | 131006899 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006899 |
| 原始查询 | SmilChr01G000927 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | basic leucine zipper 23-like |
| 产物 | basic leucine zipper 23-like |
| Arabidopsis | AT2G16770 (bZIP23)Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816178] identity=55; qcov=0.873; evalue=5.81e-49; confidence=medium |
| Rice | Os06g0716800 (OsbZIP53)- identity=47.6; qcov=0.96; evalue=3.23e-43; confidence=medium |
| GO | GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07716 (bZIP_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006899 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790030.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790030.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790030.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790030.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057790030.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:19658873 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057790030.1PF07716
bZIP_2 76-123 aa
XP_057790031.1PF07716
bZIP_2 76-123 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057790030.1 |
Pfam | PF07716 |
bZIP_2 | Coiled-coil | 76 | 123 | 8.2e-09 | 36.1 | Basic region leucine zipper |
XP_057790031.1 |
Pfam | PF07716 |
bZIP_2 | Coiled-coil | 76 | 123 | 8.2e-09 | 36.1 | Basic region leucine zipper |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。