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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000930`

染色体: Chr01 坐标: 19677595-19681157 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000930`
名称	SmilChr01G000930
描述	uncharacterized SmilChr01G000930
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19677595 - 19681157 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994060`
GeneID	`130994060`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994060`
原始查询	`SmilChr01G000930`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=31.7; qcov=0.473; evalue=4.02e-63; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=33.6; qcov=0.369; evalue=7.3e-70; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994060

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775098.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775098.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057775098.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775098.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775098.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19677734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:19677761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:19677765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B11,B53,B63,B83
`Chr1:19677766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B11,B53,B63,B83
`Chr1:19677831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B114,B119,B121,B129,B36,B38,B39,B53,B64,B86,B87,C10,C12,C49,C77,C81
`Chr1:19677855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:19677961`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A16,A19,A5,B1,B105,B108,B49,B50,B58,B69,B77,B8,C10,C16,C23,C26,C56,C61,C65,C70,C85
`Chr1:19677978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:19677980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:19677988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B19
`Chr1:19678093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B61
`Chr1:19678190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B33,B99,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775098.1

1074 aa

537

1074

RVT_1

zf-RVT

RVT_3

PF00078 RVT_1 298-512 aa PF13966 zf-RVT 772-865 aa PF13456 RVT_3 976-1058 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775098.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	298	512	1.4e-14	55.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057775098.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	772	865	1e-15	58.8	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057775098.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	976	1058	3.4e-09	37.4	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919115.1
ATGAAGCAGCTCCTACCTCTGGTAACAGATAGATTCATCTTTGGAGGAGATTTTAACGAGACTCTGTACCACTATGAAAAAAGAGGTGGTAATCCAAAACCAGACTCTCGGTTGGCGGCTTTCCGGGAAGTGGTTGATTTTTGTTCTGTTATGGATCTTGGCTTCATGGGGGAGCCTTTCACTTGGTCCAATAATCAATTGGGATCTGATAATATCTTGGAACGGCTTGACATGATTTTTGGATCTTACTCTTGGATCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994060
ATGAAGCAGCTCCTACCTCTGGTAACAGATAGATTCATCTTTGGAGGAGATTTTAACGAGACTCTGTACCACTATGAAAAAAGAGGTGGTAATCCAAAACCAGACTCTCGGTTGGCGGCTTTCCGGGAAGTGGTTGATTTTTGTTCTGTTATGGATCTTGGCTTCATGGGGGAGCCTTTCACTTGGTCCAATAATCAATTGGGATCTGATAATATCTTGGAACGGCTTGACATGATTTTTGGATCTTACTCTTGGATCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775098.1
MKQLLPLVTDRFIFGGDFNETLYHYEKRGGNPKPDSRLAAFREVVDFCSVMDLGFMGEPFTWSNNQLGSDNILERLDMIFGSYSWIDVFPGYEVTHLLRKSSDHCPILLALTKSEEDERCKLLCEDLWARGATISSTSDFQEKIELRDELEDLQKAHNEPDTKEQQRAIEKNLDELLAKEELMWKQRSRADWLAEGDRNTGFFHKVAEGRKKQNHIREIQTADGTIIRRSTNMDEIFRSYFSELFTAGPSHDPGETLSSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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