当前解析结果
SmilChr01G000931| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000931 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000931 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000931 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 19724916 - 19729375 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006896 |
|---|---|
| GeneID | 131006896 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006896 |
| 原始查询 | SmilChr01G000931 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006896 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790027.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790027.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790027.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790027.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057790027.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:19728763 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 41 | A10,A16,A24,A4,B109,B117,B120,B137,B138,B140,B17,B21,B22,B23,B29,B32,B33,B40,B44,B46,B54,B57,B66,B78,B82,B93,C12,C31,C45,C5,C51,C53,C58,C61,C7,C71,C76,C78,C79,C8,D7 |
Chr1:19728765 |
A |
ATC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 36 | A15,A19,A22,A5,A6,A9,B103,B110,B111,B118,B123,B124,B135,B139,B14,B16,B24,B54,B6,B65,B70,B77,B79,B8,B88,C18,C21,C22,C39,C55,C61,C67,C75,C80,C84,C85 |
Chr1:19728791 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr1:19728792 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr1:19728793 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B79,C61 |
Chr1:19728800 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 25 | A21,A4,B112,B113,B115,B122,B130,B42,B43,B47,B68,B72,B78,C10,C27,C38,C42,C43,C48,C56,C6,C60,C63,C65,C9 |
Chr1:19728905 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B71,C62,C65 |
Chr1:19728942 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,C62 |
Chr1:19728959 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr1:19728965 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr1:19728975 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | A3 |
Chr1:19728975 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。