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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000935`

染色体: Chr01 坐标: 19827940-19829163 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000935`
名称	SmilChr01G000935
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19827940 - 19829163 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994245`
GeneID	`130994245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994245`
原始查询	`SmilChr01G000935`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=26.2; qcov=0.703; evalue=4.6e-33; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=29.1; qcov=0.71; evalue=9.18e-40; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994245

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775288.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057775288.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775288.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775288.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19827954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A11,B30,B5,B62,C58
`Chr1:19827954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B30,B5,B62,C58
`Chr1:19827964`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	98	A14,A16,A19,A20,A21,A25,A8,B100,B102,B106,B108,B110,B114,B118,B119,B12,B121,B124,B126,B127,B129,B133,B140,B15,B19,B2,B27,B29,B3,B30,B38,B39,B41,B42,B44,B45,B49,B50,B51,B53,B55,B62,B64,B71,B74,B76,B78,B79,B8,B80,B83,B84,B86,B87,B90,B93,B94,B97,B99,C10,C12,C13,C14,C22,C23,C26,C27,C28,C3,C30,C34,C37,C39,C43,C44,C45,C46,C49,C53,C59,C60,C61,C62,C72,C73,C77,C79,C81,C84,C86,C9,D1,D10,D2,D3,D5,D8,D9
`Chr1:19827966`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A23,B111,B95
`Chr1:19827966`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A23,B111,B95
`Chr1:19827972`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	42	A1,A7,B100,B105,B109,B110,B120,B133,B138,B139,B140,B19,B24,B30,B33,B36,B38,B39,B45,B52,B57,B58,B59,B64,B67,B69,B81,B82,B95,C14,C15,C17,C2,C24,C33,C34,C41,C50,C52,C54,C61,C74
`Chr1:19827982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	54	A1,A5,A7,A9,B10,B100,B104,B105,B109,B110,B115,B120,B128,B133,B135,B139,B19,B20,B24,B30,B35,B36,B38,B39,B45,B52,B57,B58,B59,B64,B67,B69,B73,B81,B91,B95,B98,C14,C15,C17,C2,C24,C33,C34,C36,C41,C49,C50,C52,C54,C57,C74,D10,D11
`Chr1:19827990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A5,B105,B42,B51,B80,C61,C62
`Chr1:19828026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:19828030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C3,C63,C67,D8
`Chr1:19828042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B83
`Chr1:19828052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775288.1

407 aa

204

407

MULE

PF10551 MULE 2-40 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775288.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	2	40	8.2e-07	30.0	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919305.1
ATGAATGCAAAGGAACCAGAAGTTGTATTCTCCGATCAATGTCAAGCTTTAATGAATGGTATTGATGCTCAATTCAAAGCTGCGAGCCATCGCCTATGCCAATGGCATATCAATCAAAATGCCCATTCTCACTTTGGTTCCTTGAATGGTAACAATGACTTCAAAAGAGCATGGCATCATTGTATGAATTGGTGCGAGAGTGAAGAAGAATTCGAAAGCTTGTGGAAGAAAATGATTGAAGATTATGGGTTGGCTGAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994245
ATGAATGCAAAGGAACCAGAAGTTGTATTCTCCGATCAATGTCAAGCTTTAATGAATGGTATTGATGCTCAATTCAAAGCTGCGAGCCATCGCCTATGCCAATGGCATATCAATCAAAATGCCCATTCTCACTTTGGTTCCTTGAATGGTAACAATGACTTCAAAAGAGCATGGCATCATTGTATGAATTGGTGCGAGAGTGAAGAAGAATTCGAAAGCTTGTGGAAGAAAATGATTGAAGATTATGGGTTGGCTGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775288.1
MNAKEPEVVFSDQCQALMNGIDAQFKAASHRLCQWHINQNAHSHFGSLNGNNDFKRAWHHCMNWCESEEEFESLWKKMIEDYGLAEHRWFGSMYKLRKRWASVFTNSRFSAGLHATSRSEVTNKVLKDLCASSGSLFNFVQKYEQIQKDWRVKERADDALCIGTPGQFVEHNPLVMAAAKHFTRAVFVSYEFEANHSLNVSIIGNLTADDVQQLSFVVKTTTNPLCTRCVIFHRTSHEASCSCRLWKTSGILCCHIFRIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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