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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000936`

染色体: Chr01 坐标: 19836563-19837390 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000936`
名称	SmilChr01G000936
描述	uncharacterized SmilChr01G000936
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19836563 - 19837390 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994304`
GeneID	`130994304`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994304`
原始查询	`SmilChr01G000936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proteinase inhibitor I4, serpin (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841966]; symbol=AT1G55230; hit=AT1G55230; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	proteinase inhibitor I4, serpin (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841966]; symbol=AT1G55230; hit=AT1G55230; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G55230` (AT1G55230) proteinase inhibitor I4, serpin (DUF716) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841966] identity=44.7; qcov=1.03; evalue=1.27e-80; confidence=medium
Rice	`Os09g0444900` - identity=47; qcov=0.967; evalue=2.37e-62; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04819 (DUF716)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994304

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057775354.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057775354.1`
3	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057775354.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057775354.1`
5	Lysosome membrane	溶酶体膜	0.20000	`XP_057775354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19836778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:19836817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:19836940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B33,B82,C61,D7
`Chr1:19837066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:19837114`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C41
`Chr1:19837114`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C41
`Chr1:19837133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C3,C63,C67,D8
`Chr1:19837148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:19837180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:19837198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:19837282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775354.1

275 aa

138

275

DUF716

PF04819 DUF716 117-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775354.1`	Pfam	`PF04819`	DUF716	Family	117	248	3.1e-43	147.4	Family of unknown function (DUF716)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919371.1
ATGCAGGGAGGCACATCAGGCCATGTATCACTAGGGTTTGCATTCTTGATCATAGGAATGTGGCACCTCTTCAACTCCATCAAGCACCACTCTCTCCACCCAAAAACCTTCATTTCCCTCCCATGGTTCCCTGTCCCAAGATTCAAATACCTAGAGCCCATCACCATCATCTTGGTCACATCTGTCTTCATAATCTCGGAGCTTTTCGCCGGCGGCGGGCGCCCCGCCACAGCACCCAATAACCTCCGCCACCTGGAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994304
ATGCAGGGAGGCACATCAGGCCATGTATCACTAGGGTTTGCATTCTTGATCATAGGAATGTGGCACCTCTTCAACTCCATCAAGCACCACTCTCTCCACCCAAAAACCTTCATTTCCCTCCCATGGTTCCCTGTCCCAAGATTCAAATACCTAGAGCCCATCACCATCATCTTGGTCACATCTGTCTTCATAATCTCGGAGCTTTTCGCCGGCGGCGGGCGCCCCGCCACAGCACCCAATAACCTCCGCCACCTGGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775354.1
MQGGTSGHVSLGFAFLIIGMWHLFNSIKHHSLHPKTFISLPWFPVPRFKYLEPITIILVTSVFIISELFAGGGRPATAPNNLRHLEHSIIAISFSLYAVFAVLFDRIAAPLPAQRVLLHLLQAAAFAQQLLILHLHSTDHAGVEGQYHWLMQIVTLVTLIATISVAGNPASFLSSFVRGFSVIFQGIWLVVMGFMLWTPEWMPEGCFLKAEAVLCHGDRALRRAKALVNLQFGLYLIALTVCAMVFYLVVIKFYPQEKAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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