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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000938`

染色体: Chr01 坐标: 19852879-19859352 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000938`
名称	SmilChr01G000938
描述	anaphase-promoting complex subunit 7
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19852879 - 19859352 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006891`
GeneID	`131006891`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006891`
原始查询	`SmilChr01G000938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	anaphase-promoting complex subunit 7
产物	anaphase-promoting complex subunit 7
Arabidopsis	`AT2G39090` (APC7) tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818495] identity=67.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0149900` (APC7) - identity=67.4; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0051301 (cell division)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13181 (TPR_8); PF14559 (TPR_19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006891

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790020.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057790020.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790020.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057790020.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057790020.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19853113`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B111,B131,B3,B33,B4,B47,B69,B99,C44,C46,C57,D5
`Chr1:19853605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C17
`Chr1:19854162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:19857540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:19857544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:19858977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790020.1

564 aa

282

564

TPR_8

TPR_19

PF13181 TPR_8 356-385 aa PF14559 TPR_19 439-488 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790020.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	356	385	1e-19	69.7	Tetratricopeptide repeat
`XP_057790020.1`	Pfam	`PF14559`	TPR_19	Repeat	439	488	1.5e-22	80.4	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934037.1
AATTTTCACCGAACAAACGATTTCAAATAAGAAGAGCGCTTCGACTCTCAAAAGGAAGAAAAAAAGGAAAAAAATAAAAATAAAAGAAAGGAAAGAAGAGCGCTTCACTCCGTCGCTCCCAGACGCTTCACACACAAGACACAGCTCACGCAGCACTCCAACTGTTCGATGGATGTTCCCAAAGACCAATTACACACTCTTCTGGATCATGGTCTCTTCTCTTCTGCTCAAATTCTGGGTTGTTTTGCTGTATCTTCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006891
ATGGATGTTCCCAAAGACCAATTACACACTCTTCTGGATCATGGTCTCTTCTCTTCTGCTCAAATTCTGGGTTGTTTTGCTGTATCTTCAACGTCGATAAATCCTGAGACGAGCCCTCATCTCAAAGCTGAAAGCTTGGTTCTGTTCGGTGATTCGCTCTTTCGAGAGAAGGAGCATCGAAGGGCAATTCAAGTATATAAACAAGCGTTGCAGTGCCACAAAATACTACCAAAACAAACTGCAAATACAACTCCAACAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790020.1
MDVPKDQLHTLLDHGLFSSAQILGCFAVSSTSINPETSPHLKAESLVLFGDSLFREKEHRRAIQVYKQALQCHKILPKQTANTTPTTRSTLPASNRSSSPNSCNTSAINENEVKFKIATCHSSLGENRAALAEMEGIPSKSRNLEMNLMMAKLYRNSRHTRAAIGCFKECLRNCPYIFEAIIALAELGVLAKDIISLFPQTPSRSGRPPFDHFDSSRWLARYVEAQCCIASNDYKGGLDLFSELLQRFPNNIHILLEMAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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