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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000952`

染色体: Chr01 坐标: 20146003-20159508 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000952`
名称	SmilChr01G000952
描述	F-box/WD-40 repeat-containing protein At3g52030
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20146003 - 20159508 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006920`
GeneID	`131006920`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006920`
原始查询	`SmilChr01G000952`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/WD-40 repeat-containing protein At3g52030
产物	F-box/WD-40 repeat-containing protein At3g52030
Arabidopsis	`AT3G52030` (AT3G52030) F-box family protein with WD40/YVTN repeat doamin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824366] identity=46.6; qcov=1.06; evalue=4.19e-127; confidence=high
Rice	`Os11g0182400` (OsWD40-184) - identity=41.6; qcov=1.02; evalue=6.37e-103; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006920

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790044.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790044.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790044.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790044.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790044.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20146169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:20146405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C82
`Chr1:20147964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:20159356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C42
`Chr1:20159399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790044.1

434 aa

217

434

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 29-66 aa PF12937 F-box-like 31-62 aa

XP_057790045.1

401 aa

200

401

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 29-66 aa PF12937 F-box-like 31-62 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790044.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	29	66	4.4e-09	36.6	F-box domain
`XP_057790044.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	31	62	1e-06	29.1	F-box-like
`XP_057790045.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	29	66	3.8e-09	36.8	F-box domain
`XP_057790045.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	31	62	9e-07	29.3	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934062.1
CAAGAAAAAGAAAAAGGAAAAGAAAAGAAAGGGAAATGTGACAACCGTGAAAAGGGGACATGGGCTAGAAGAAAGTAGACCGCCACATACACATGGACCCTATGTCATCCGCTAACATCCGGCCGCCGGCGTCGGCGAAGCGTCACCGCCGTGCCTCCCTAACCTCCATTGACGCTCTCGGAGACGACGCTCTCTGCGTGATTTTTGCTTTTCTCAACCTCGTCCACCTAATTCGCTGCTCTGCCGTCTGCAAGTCATGG...

XM_057934061.1
CAAGAAAAAGAAAAAGGAAAAGAAAAGAAAGGGAAATGTGACAACCGTGAAAAGGGGACATGGGCTAGAAGAAAGTAGACCGCCACATACACATGGACCCTATGTCATCCGCTAACATCCGGCCGCCGGCGTCGGCGAAGCGTCACCGCCGTGCCTCCCTAACCTCCATTGACGCTCTCGGAGACGACGCTCTCTGCGTGATTTTTGCTTTTCTCAACCTCGTCCACCTAATTCGCTGCTCTGCCGTCTGCAAGTCATGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006920
ATGGACCCTATGTCATCCGCTAACATCCGGCCGCCGGCGTCGGCGAAGCGTCACCGCCGTGCCTCCCTAACCTCCATTGACGCTCTCGGAGACGACGCTCTCTGCGTGATTTTTGCTTTTCTCAACCTCGTCCACCTAATTCGCTGCTCTGCCGTCTGCAAGTCATGGAGGACAGTGATTAGTAAACTGAAGCTGCTGCAAATACAGTATCACAAGCTACAGCAGGCTGATTCTGCTAGCGTCTCTGATTTGTCTAATTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790044.1
MDPMSSANIRPPASAKRHRRASLTSIDALGDDALCVIFAFLNLVHLIRCSAVCKSWRTVISKLKLLQIQYHKLQQADSASVSDLSNYSEKLINIQMEQLAMDQQRSSLQEGPVRVFQWKAHSVGFNKCRMKRGLILTGVGDKVMRLWSAESCKGLDEYQLPDRAPLIDFDFDEGKVVGLVGTRICIWRRFGTRDLFSSREGLFTRGLCMCYVDPQAVVGCEDGKVRVFDMYSKKISQIIKMHPGAVSSLCFSDEQLIVSG...

XP_057790045.1
MDPMSSANIRPPASAKRHRRASLTSIDALGDDALCVIFAFLNLVHLIRCSAVCKSWRTVISKLKLLQIQYHKLQQADSASVSDLSNYSEKLINIQMEQLAMDQQRSSLQEGPVRVFQWKAHSVGFNKCRMKRGLILTGVGDKVVGLVGTRICIWRRFGTRDLFSSREGLFTRGLCMCYVDPQAVVGCEDGKVRVFDMYSKKISQIIKMHPGAVSSLCFSDEQLIVSGSSLGSISISDLSSDQRVVSFDATSSAGIKTLCL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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