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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000954`

染色体: Chr01 坐标: 20173060-20175619 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000954`
名称	SmilChr01G000954
描述	uncharacterized SmilChr01G000954
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20173060 - 20175619 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006922`
GeneID	`131006922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006922`
原始查询	`SmilChr01G000954`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Uncharacterized protein family (UPF0114) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831217]; symbol=AT5G13720; hit=AT5G13720; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Uncharacterized protein family (UPF0114) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831217]; symbol=AT5G13720; hit=AT5G13720; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G13720` (AT5G13720) Uncharacterized protein family (UPF0114) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831217] identity=80; qcov=0.681; evalue=1.59e-118; confidence=high
Rice	`Os07g0656700` (P0047B07.113) - identity=61.1; qcov=0.94; evalue=7.26e-117; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03350 (UPF0114)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057790046.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057790046.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790046.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790046.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20173261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:20173272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B88,C18
`Chr1:20173906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:20173967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:20174550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:20175378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B75,B88,C18,C42
`Chr1:20175402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B75,B88,C18,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790046.1

301 aa

150

301

UPF0114

PF03350 UPF0114 125-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790046.1`	Pfam	`PF03350`	UPF0114	Family	125	263	7.3e-35	120.5	Uncharacterized protein family, UPF0114

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934063.1
ATAGAAAAGTAACCGTTGGTTCGGTTCGCGCTACCCGCTATGAGCTGATTGCGAAATGCACACCGACTTTTCCAAGACACATACAGTCCACGAGACTGCCAAACAAAGATCTACACTTGTTTTCTTAATTTTTCTATCAATGGCGGCGCTGCTCTCATCTTCAGTTTCAGCCAGCGCTCTCTCGCTATTCAAATCTAATCCACACTTTACCAAGGAAGGTTCCAGAAAACGCTCAATCTCACTGTCTGCTTCCTCAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006922
ATGCACACCGACTTTTCCAAGACACATACAGTCCACGAGACTGCCAAACAAAGATCTACACTTGTTTTCTTAATTTTTCTATCAATGGCGGCGCTGCTCTCATCTTCAGTTTCAGCCAGCGCTCTCTCGCTATTCAAATCTAATCCACACTTTACCAAGGAAGGTTCCAGAAAACGCTCAATCTCACTGTCTGCTTCCTCAGCAGAGGCTTCTCAAGAATCACAATCAACTGAAAAGTTTGGAGTTTCGGCAAAAGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790046.1
MHTDFSKTHTVHETAKQRSTLVFLIFLSMAALLSSSVSASALSLFKSNPHFTKEGSRKRSISLSASSAEASQESQSTEKFGVSAKGKAPFVEPPELPYNYTLANPNGSSVVQFVQSTESNIERVIFDFRFLALLAVAGSLAGSVLCFLNGCVYIFDAYKVYWTSCVKGVHSGQMVLRLVEAIDVYLAGTVMLIFGMGLYGLFISNVPPNVPAASDRALKGSSLFGMFALKERPKWMKISSLNELKTKVGHVIVMILLVKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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