当前解析结果
SmilChr01G000958| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000958 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000958 |
| 描述 | uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 20299547 - 20299906 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994950 |
|---|---|
| GeneID | 130994950 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994950 |
| 原始查询 | SmilChr01G000958 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | ATMG00810- identity=35; qcov=1.01; evalue=6.1e-20; confidence=low |
| Rice | Os08g0125300- identity=37.7; qcov=0.958; evalue=1.39e-23; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994950 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057776173.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057776173.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057776173.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057776173.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057776173.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:20299648 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A10,B48,D2 |
Chr1:20299658 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 119 | A1,A13,A14,A18,A24,A4,A5,A7,A9,B1,B10,B100,B105,B106,B108,B112,B115,B117,B119,B121,B126,B128,B129,B131,B132,B133,B134,B135,B140,B15,B17,B18,B19,B20,B26,B30,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B58,B59,B61,B62,B63,B64,B69,B71,B73,B75,B76,B80,B82,B85,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B96,B97,B98,C1,C10,C16,C17,C19,C2,C20,C23,C25,C26,C29,C30,C33,C34,C36,C38,C4,C40,C42,C43,C47,C49,C51,C52,C55,C57,C59,C61,C7,C71,C72,C77,C79,C84,C87,C9,D10,D6 |
Chr1:20299693 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B139 |
Chr1:20299828 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B24,B53,B78,B92 |
Chr1:20299849 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B24,B53,B92 |
Chr1:20299852 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B67,B71,C14,C53 |
Chr1:20299867 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C14,C53 |
Chr1:20299872 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B53,C14,C53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。