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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000975`

染色体: Chr01 坐标: 20601292-20603962 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000975`
名称	SmilChr01G000975
描述	uncharacterized SmilChr01G000975
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20601292 - 20603962 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995459`
GeneID	`130995459`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995459`
原始查询	`SmilChr01G000975`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=50; qcov=0.218; evalue=5.84e-33; confidence=weak
Rice	`Os06g0597250` - identity=50.5; qcov=0.662; evalue=1.03e-141; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF14303 (NAM-associated); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995459

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057776759.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057776759.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057776759.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057776759.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057776759.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20601476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B71,B95,C39
`Chr1:20601481`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B122
`Chr1:20601481`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B122
`Chr1:20601485`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr1:20601485`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr1:20601492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B122,B22,B48,B65,C25
`Chr1:20601492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B22,B48,B65,C25
`Chr1:20601548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B23,B60,B86,C15
`Chr1:20601589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,C78,C9
`Chr1:20601593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B71,C21,C84
`Chr1:20601615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:20601632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057776759.1

595 aa

298

595

NAM-associated

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF14303 NAM-associated 48-176 aa PF28509 DUF8418 212-251 aa PF04827 Plant_tran 320-525 aa PF13359 DDE_Tnp_4 349-515 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057776759.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	48	176	1.3e-06	30.1	No apical meristem-associated C-terminal domain
`XP_057776759.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	212	251	3.4e-18	65.8	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057776759.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	320	525	4e-103	344.1	Plant transposon protein
`XP_057776759.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	349	515	4.6e-11	43.3	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057920776.1
ATGGAAACAAATGGGTTGGCTTGTAGGGAAGCAAATGCTCGAAGAAGGAGTGGAATGAGCGACAATGATGTTGAGAAAGAAGCTCATTCCATTTACGAAGTAGGTGGAAGCAAGTTTGTAGACTTGGTTGTATTTAATGAAGTTATGAGTAAACATCCCAAATGGAATGTTCATGATACCACCCATGTTTTTCATCGTCAAAGTGAAGATGTTGATGACCAGCAAAGTGGTGGCAGTTCAAAAAGATCAAAGACTTCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995459
ATGGAAACAAATGGGTTGGCTTGTAGGGAAGCAAATGCTCGAAGAAGGAGTGGAATGAGCGACAATGATGTTGAGAAAGAAGCTCATTCCATTTACGAAGTAGGTGGAAGCAAGTTTGTAGACTTGGTTGTATTTAATGAAGTTATGAGTAAACATCCCAAATGGAATGTTCATGATACCACCCATGTTTTTCATCGTCAAAGTGAAGATGTTGATGACCAGCAAAGTGGTGGCAGTTCAAAAAGATCAAAGACTTCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057776759.1
METNGLACREANARRRSGMSDNDVEKEAHSIYEVGGSKFVDLVVFNEVMSKHPKWNVHDTTHVFHRQSEDVDDQQSGGSSKRSKTSEDGRFSIPSNPETPTSEQSTATRPIGRYKAKRKGKGKVSQSECTHESAVAAEIRAMRLTRDVEAELIKTRIELEREKLQRNAMKMKEKMLLQLLAKKHLSPEDEEMKRNQIPTANRRYCDREREFGAERLINNYFSDSPTYTPEIFRRRFRKQKPLFIRIVEAVTTNDEFFQQR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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