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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000982`

染色体: Chr01 坐标: 20792038-20795706 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000982`
名称	SmilChr01G000982
描述	uncharacterized SmilChr01G000982
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20792038 - 20795706 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130995769`
GeneID	`130995769`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130995769`
原始查询	`SmilChr01G000982`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=38.5; qcov=0.113; evalue=1.87e-16; confidence=weak
Rice	`Os08g0202300` - identity=33.5; qcov=0.277; evalue=7.51e-36; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF00665 (rve); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130995769

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777202.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057777202.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057777202.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057777202.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777202.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20792242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D2
`Chr1:20792308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B26
`Chr1:20792347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:20792397`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B26
`Chr1:20792397`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B26
`Chr1:20792421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C30
`Chr1:20792533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B1,B117,B7
`Chr1:20792713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr1:20793150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr1:20793162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:20793164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:20793167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777202.1

852 aa

426

852

RVT_1

RT_RNaseH_2

rve

PF00078 RVT_1 1-81 aa PF17919 RT_RNaseH_2 145-209 aa PF00665 rve 279-372 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777202.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	1	81	3.5e-13	50.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057777202.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	145	209	1.7e-12	48.0	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057777202.1`	Pfam	`PF00665`	rve	Domain	279	372	6.6e-13	49.5	Integrase core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921219.1
TTTTTACTGTTTTCTTGATGGTTTGTCAGGTTATTACCAAATAGCAATCGCGCCGGAGGACCAGGACAAGACGGCGTTCACAACCCCTTTTGGTACCTTTGCGTGGAAGAGGATGCCTTTTGGGCTGTGCAATGCACCGGGGACCTTCCAACGGTGCATGATGTCGATCTTCGCAGAAATGATAGGTGATTTTGTTGAAATTTTCATGGATGACTTTTCCGTGTTTGGAAATTCGTATAGTGATTGCTTGGGTAAAATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130995769
ATGCCTTTTGGGCTGTGCAATGCACCGGGGACCTTCCAACGGTGCATGATGTCGATCTTCGCAGAAATGATAGGTGATTTTGTTGAAATTTTCATGGATGACTTTTCCGTGTTTGGAAATTCGTATAGTGATTGCTTGGGTAAAATTAATTTGGTTTTGAAAAGGTGTATAGAGAGTGGGTTAACTCTTAGTTGGGAGAAGAGTCACTTCATGGTGACTAGTGGCATCGTTCTTGGCCACGTGGTGTCAAAAGATGGTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777202.1
MPFGLCNAPGTFQRCMMSIFAEMIGDFVEIFMDDFSVFGNSYSDCLGKINLVLKRCIESGLTLSWEKSHFMVTSGIVLGHVVSKDGIEVDRAKVEVIEKLPPPIDVKGIRSFLGHAEFYRRFIKDFSKIAQPLCRLLAQEVDFDFNETCMHAFELLKLKLSTAPVVVAPDWSLPFEIMCDASNSAVGAVLGQRVDKMLRVIYYARELRPDLTSQERKRFLATCRQYYWEDPYLFKLGKDEVIRRCIPDVEACDRCQRVGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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