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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000986`

染色体: Chr01 坐标: 20874144-20879304 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000986`
名称	SmilChr01G000986
描述	chaperonin-like RbcX protein 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20874144 - 20879304 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006948`
GeneID	`131006948`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006948`
原始查询	`SmilChr01G000986`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperonin-like RbcX protein 2, chloroplastic
产物	chaperonin-like RbcX protein 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G19855` (RbcX2) Chaperonin-like RbcX protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832106] identity=45; qcov=1; evalue=1.41e-40; confidence=medium
Rice	`Os07g0569600` - identity=59.8; qcov=0.544; evalue=3.87e-36; confidence=medium
GO	GO:0044183 (protein folding chaperone); GO:0110102 (ribulose bisphosphate carboxylase complex assembly)
KEGG	-
Pfam	PF02341 (RbcX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006948

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057790070.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057790071.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057790070.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790070.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790070.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20874317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:20878451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B41,B62,C30,C42
`Chr1:20878630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B57,C74
`Chr1:20878804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B48,C41
`Chr1:20878896`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B66,B93
`Chr1:20878896`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B66,B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790070.1

208 aa

104

208

RbcX

PF02341 RbcX 91-192 aa

XP_057790071.1

169 aa

169

RbcX

PF02341 RbcX 91-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790070.1`	Pfam	`PF02341`	RbcX	Family	91	192	4.9e-18	66.1	RbcX protein
`XP_057790071.1`	Pfam	`PF02341`	RbcX	Family	91	160	2.1e-16	60.9	RbcX protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934088.1
CATTGTCTATAATTCACATAAATATCTGAACGTGAAGCCAGATTCTTGAAGATAAATCAAAGAGGCAGAAGATTTTTTTGGTTTTGTTAGAATCTTTCTCCAGGTGGCGCCTTGCTCAGAATTATCTCTTCAGTTCATTTGACAGCAGCATTGTTTAATACTCCATTGAAGCAATGGGTGAATCATGGGCATGTTTATGCGTGGACAGCATCATGCCTTCAACCATAAAGGGAAACAACTGTGTCTCTTATTTCTACAGA...

XM_057934087.1
TTGGCAACTCTGCTCCATTCATGTGAGATATGACAAAACAAGAATTAGTATAGTGGAGAATTTGGGACCTCACAAATATTTGAAAAAAAAAACACACACACACACACAAGGAAAACATTGTCTATAATTCACATAAATATCTGAACGTGAAGCCAGATTCTTGAAGATAAATCAAAGAGGCAGAAGATTTTTTTGGTTTTGTTAGAATCTTTCTCCAGGTGGCGCCTTGCTCAGAATTATCTCTTCAGTTCATTTGACAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006948
ATGGGTGAATCATGGGCATGTTTATGCGTGGACAGCATCATGCCTTCAACCATAAAGGGAAACAACTGTGTCTCTTATTTCTACAGAAACGTAGGGAAAAGAAGGCAATTGCAGCAGCAACAGCAGAGGATGGTGCATTTGAGCAATTCTTTCTTGGATCCATGGCCTGCAAAAATGGTGTCAATCTGCACTAGTTCAACAAAGAGACACAAGCTTCAACGCCTCATCGTTGTGGATGAACTAGGGGGGCAATACGAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790070.1
MGESWACLCVDSIMPSTIKGNNCVSYFYRNVGKRRQLQQQQQRMVHLSNSFLDPWPAKMVSICTSSTKRHKLQRLIVVDELGGQYEDTFNDVKMELVEFFTFKAVRTVLEQLYEMNPPQYKWFNNFVADNVPSKGNRFLQTLVKERRELAERVMITRLTLYGRWIKKCDLGEIYKEISDENLKLMRERLLETIQWPSDDNSKSDQDTD

XP_057790071.1
MGESWACLCVDSIMPSTIKGNNCVSYFYRNVGKRRQLQQQQQRMVHLSNSFLDPWPAKMVSICTSSTKRHKLQRLIVVDELGGQYEDTFNDVKMELVEFFTFKAVRTVLEQLYEMNPPQYKWFNNFVADNVPSKGNRFLQTLVKERRELAERVMITRLTLYGRWIKAPG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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