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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000988`

染色体: Chr01 坐标: 20879571-20887151 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000988`
名称	SmilChr01G000988
描述	cellulose synthase A catalytic subunit 3 [UDP-forming]-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20879571 - 20887151 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006947`
GeneID	`131006947`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006947`
原始查询	`SmilChr01G000988`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cellulose synthase A catalytic subunit 3 [UDP-forming]-like
产物	cellulose synthase A catalytic subunit 3 [UDP-forming]-like
Arabidopsis	`AT5G05170` (CEV1) Cellulose synthase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830399] identity=83.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0208500` (OsCesA8) - identity=82.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009833 (plant-type primary cell wall biogenesis); GO:0016760 (cellulose synthase (UDP-forming) activity); GO:0030244 (cellulose biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF03552 (Cellulose_synt); PF13632 (Glyco_trans_2_3); PF14569 (zf-UDP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006947

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057790069.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057790069.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790069.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790069.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790069.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20879844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C5
`Chr1:20879853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C5
`Chr1:20879886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:20879946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B49,B7,C5
`Chr1:20880267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:20880451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:20880523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C1,C45
`Chr1:20882202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:20882739`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B14
`Chr1:20882739`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B14
`Chr1:20883064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B114
`Chr1:20883342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790069.1

1065 aa

532

1065

zf-UDP

Cellulose_synt

Glyco_trans_2_3

PF14569 zf-UDP 10-86 aa PF03552 Cellulose_synt 337-1058 aa PF13632 Glyco_trans_2_3 748-864 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790069.1`	Pfam	`PF14569`	zf-UDP	Domain	10	86	3.4e-41	139.9	Zinc-binding RING-finger
`XP_057790069.1`	Pfam	`PF03552`	Cellulose_synt	Domain	337	1058	0	1383.5	Cellulose synthase
`XP_057790069.1`	Pfam	`PF13632`	Glyco_trans_2_3	Domain	748	864	1.4e-07	32.2	Glycosyl transferase family group 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934086.1
TCCCTTCCACGCCATTTTTTATATTCCTCATATTTTTATTGCGACGGACAATCATAATAATTGAGATTTGAGAACTACCCACTCATTAACAGCTATACATACACTGACCTTTATATCTCTCTCTAGTGAGAGAAAACTGAAGAGAGAGAAGCCGAGCCGACAGCTAGTGGTTCTACTCGCTCTGCTCTCCACTGCTTCTCTCATCCGCATTTCCATCTTCTGTTGTGCTTTTAGCATTGTGTTCAGATCGGTTGTGGACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006947
ATGGAACCTGAAGCAGAAATCAAGGGAAAGACCTTGAAGACCATGGGCAGCCAGGTCTGTCAGATCTGTGGGGATGACGTGGGTTTAACTGCTGACCTTGAGCCATTTGTTGCTTGCAATGTCTGTGCATTCCCGGTTTGCAGGCCTTGCTATGAATATGAGAGAAAGGATGGAAATCAGTCTTGCCCTCAGTGCAAAACCAGATACAAGAGACATAAAGGGAGTCCTGCAATTCATGGTGATAGTGAGGAGGATGGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790069.1
MEPEAEIKGKTLKTMGSQVCQICGDDVGLTADLEPFVACNVCAFPVCRPCYEYERKDGNQSCPQCKTRYKRHKGSPAIHGDSEEDGVADDVVDDVHYSETQSDKQKISERMLSWRVNHAGESLNAPKYDKEVPQNHIPLLTNGTDISGELSAASPGRLSMASPPPGGGGKPRIVDPVREFGSPGLGNVAWKERVDGWKMKQEKPVIPMTTSHPPSERGVGDIDASTDVLVDDSLLNDEARQPLSRKVSIPSSRINPYRMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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