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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000993`

染色体: Chr01 坐标: 20955086-20964596 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000993`
名称	SmilChr01G000993
描述	uncharacterized SmilChr01G000993
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20955086 - 20964596 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006950`
GeneID	`131006950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006950`
原始查询	`SmilChr01G000993`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	folate-sensitive fragile site protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827162]; symbol=AT4G15030; hit=AT4G15030; species=arabidopsis; confidence=high
产物	folate-sensitive fragile site protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827162]; symbol=AT4G15030; hit=AT4G15030; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G15030` (AT4G15030) folate-sensitive fragile site protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827162] identity=70.3; qcov=0.98; evalue=6.55e-80; confidence=high
Rice	`Os11g0639000` - identity=68.7; qcov=0.974; evalue=5.48e-77; confidence=high
GO	GO:0016311 (dephosphorylation); GO:0016791 (phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF09725 (Fra10Ac1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790072.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057790073.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790074.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790072.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790072.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20955453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B82,C13,C35
`Chr1:20963178`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B108,B128,B20,B25,B86,B98,C23,C36,C49,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790072.1

234 aa

117

234

Fra10Ac1

PF09725 Fra10Ac1 59-175 aa

XP_057790073.1

168 aa

168

Fra10Ac1

PF09725 Fra10Ac1 59-168 aa

XP_057790074.1

151 aa

151

Fra10Ac1

PF09725 Fra10Ac1 59-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790072.1`	Pfam	`PF09725`	Fra10Ac1	Family	59	175	5.4e-50	169.2	Folate-sensitive fragile site protein Fra10Ac1
`XP_057790073.1`	Pfam	`PF09725`	Fra10Ac1	Family	59	168	2.6e-47	160.5	Folate-sensitive fragile site protein Fra10Ac1
`XP_057790074.1`	Pfam	`PF09725`	Fra10Ac1	Family	59	148	1.8e-37	128.8	Folate-sensitive fragile site protein Fra10Ac1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095834.1
TGGATTTAGTGGCCATCAGTAGAGTATGACTTAACACTCCTTCGGAAGAGTAATGAAAGTACAAAGCAAGCAGAAGCGGTGAAAAATTCGAAGGGTAAATCAAGGCCAGAAAAGAACAGGAGTTCCCATTTGATTTCTGATCAAAATCGAACCATCGCTGGGAAATTCAAATTCATGGCGTCATTTGGATCTATTAAGCAAGCAATTTTCGAGAAACAAGCACGAAAGCAGCAGTATCAGGACCATATACGAGGGCTCAA...

XM_057934091.1
ATGGATTTAGTGGCCATCAGTAGAGTATGACTTAACACTCCTTCGGAAGAGTAATGAAAGTACAAAGCAAGCAGAAGCGGTGAAAAATTCGAAGGGTAAATCAAGGCCAGAAAAGAACAGGAGTTCCCATTTGATTTCTGATCAAAATCGAACCATCGCTGGGAAATTCAAATTCATGGCGTCATTTGGATCTATTAAGCAAGCAATTTTCGAGAAACAAGCACGAAAGCAGCAGTATCAGGACCATATACGAGGGCTCA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131006950
ATGGCGTCATTTGGATCTATTAAGCAAGCAATTTTCGAGAAACAAGCACGAAAGCAGCAGTATCAGGACCATATACGAGGGCTCAACGCATTCGATCGCCACAAGAAATTTTTGAATGATTACGTTGCTTATTATGGAAAAGAGAAATCGGCTCAAAAAATATTGCCTATTAAAACTGACCAAGACACCATTAGAGAAGGATATCGGTTCATAATGACTGAGGAAGACGACATGAATCCTTCTTGGGAACACAAGCTAGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057790072.1
MASFGSIKQAIFEKQARKQQYQDHIRGLNAFDRHKKFLNDYVAYYGKEKSAQKILPIKTDQDTIREGYRFIMTEEDDMNPSWEHKLVKRYYDKLFKEYCIADMSHYKTGKIGLRWRIEKEVISGKGQFVCGNKHCDQEDGLSSYEVNFSYFEAGENKQALVKLVACERCAEKLYYKKQKEKEQLKRKESEKHQRKRDRSESDDDTSINHGKSKERRKGIMLHRIMLLNTITYGL

XP_057790073.1
MASFGSIKQAIFEKQARKQQYQDHIRGLNAFDRHKKFLNDYVAYYGKEKSAQKILPIKTDQDTIREGYRFIMTEEDDMNPSWEHKLVKRYYDKLFKEYCIADMSHYKTGKIGLRWRIEKEVISGKGQFVCGNKHCDQEDGLSSYEVNFSYFEAGENKQALVKLVACER

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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