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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000997`

染色体: Chr01 坐标: 21002777-21009085 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000997`
名称	SmilChr01G000997
描述	disease resistance protein RPP13-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21002777 - 21009085 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996640`
GeneID	`130996640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996640`
原始查询	`SmilChr01G000997`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP13-like
产物	disease resistance protein RPP13-like
Arabidopsis	`AT1G59620` (CW9) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842252] identity=30.4; qcov=0.782; evalue=2.59e-43; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=27; qcov=0.893; evalue=1.56e-44; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057777952.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057777952.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777952.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777952.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777952.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21003009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C51
`Chr1:21003062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B30,C51
`Chr1:21008152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr1:21008357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B111,B35,B88
`Chr1:21008447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B131,C55
`Chr1:21008453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,D7
`Chr1:21008563`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A18,B124,B16,B6,B8,B88,C22,C67
`Chr1:21008676`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B2
`Chr1:21008676`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B2
`Chr1:21008696`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	124	A1,A10,A15,A16,A18,A19,A2,A24,A25,A6,A9,B101,B104,B11,B110,B115,B12,B121,B123,B124,B125,B128,B130,B132,B134,B136,B137,B14,B15,B16,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B25,B26,B29,B3,B30,B33,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B48,B5,B52,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B65,B68,B70,B73,B74,B75,B79,B8,B80,B82,B84,B86,B88,B89,B90,B92,B94,B96,B98,C13,C15,C16,C18,C19,C22,C23,C25,C27,C3,C31,C32,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C44,C45,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C67,C68,C74,C75,C76,C78,C80,C83,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D4,D6,D9
`Chr1:21008697`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	124	A1,A10,A15,A16,A18,A19,A2,A24,A25,A6,A9,B101,B104,B11,B110,B115,B12,B121,B123,B124,B125,B128,B130,B132,B134,B136,B137,B14,B15,B16,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B25,B26,B29,B3,B30,B33,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B48,B5,B52,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B65,B68,B70,B73,B74,B75,B79,B8,B80,B82,B84,B86,B88,B89,B90,B92,B94,B96,B98,C13,C15,C16,C18,C19,C22,C23,C25,C27,C3,C31,C32,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C44,C45,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C67,C68,C74,C75,C76,C78,C80,C83,C86,C87,C9,D10,D11,D2,D4,D6,D9
`Chr1:21008841`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B106,B81,B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777952.1

563 aa

282

563

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 174-321 aa PF23559 WHD_DRP 403-478 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777952.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	174	321	1.6e-32	113.2	NB-ARC domain
`XP_057777952.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	403	478	3.5e-07	30.9	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921969.1
GGTCCATTTTGTTGTTGACCTCTTCATAACAATACATCTTCCTTATAATTAATTCCAAAACGAGAGAGAAAAGGGGAAGATGAAGTAGAGCTCAAGAGAGTTAGAAGAAGTGGATATGGCGGAGGCAATTGTATTATCGGCGGTGGAAAAGCTGGAGAATCTGCTGGTGATTGAGGAGGGTGTTTCCAAACATCGAAAAACAGCAAAGCAGGAGAAGGAGGAGCTAGTAGTAGTAGTGGAAGGGCTGAGAGATGATCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996640
ATGGCGGAGGCAATTGTATTATCGGCGGTGGAAAAGCTGGAGAATCTGCTGGTGATTGAGGAGGGTGTTTCCAAACATCGAAAAACAGCAAAGCAGGAGAAGGAGGAGCTAGTAGTAGTAGTGGAAGGGCTGAGAGATGATCTCAGAGGGATGCTGTCTCTCTTCACTAACAACAGCACCAAGGAATCTGGAGATTACATATCTCGAGTCACGGAGATTGCTCACGACGTGGACGTCGCCATTGATAACTACATCCTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777952.1
MAEAIVLSAVEKLENLLVIEEGVSKHRKTAKQEKEELVVVVEGLRDDLRGMLSLFTNNSTKESGDYISRVTEIAHDVDVAIDNYILQDTQPKSAFFKFFKPSSGQVMNTFHGMRICLQVLWSEFSRSEEAGPTSRRIPPAVEVEVGVVEGMKEDVELVLRKAIFLEESAQGLATSCIVGMGGVGKTTLAQMLYTHERVASEFEIRAWVYVSTEFTSKQVLKELILQFGVNYDEVDAHEPSRLRDMVFQHLHTRRYFIILD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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