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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001010`

染色体: Chr01 坐标: 21227796-21232654 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001010`
名称	SmilChr01G001010
描述	uncharacterized SmilChr01G001010
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21227796 - 21232654 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997001`
GeneID	`130997001`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997001`
原始查询	`SmilChr01G001010`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834845]; symbol=AT5G47940; hit=AT5G47940; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	40S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834845]; symbol=AT5G47940; hit=AT5G47940; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G47940` (AT5G47940) 40S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834845] identity=38.2; qcov=0.542; evalue=3.27e-61; confidence=medium
Rice	`Os07g0569000` - identity=30; qcov=0.743; evalue=3.23e-49; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997001

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778300.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057778300.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778300.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057778300.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778300.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21228551`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A16,A18,B103,B106,B121,B124,B135,B2,B41,B76,B81,B90,B95,C1,C2,C34,C35,C51,C60,C64,C66,C67,C70,D11,D6
`Chr1:21228597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,B63
`Chr1:21228625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A1,B129,B22,B3,B48,C25,C37,C53,C78,D2
`Chr1:21228766`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr1:21228766`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr1:21228848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,C8
`Chr1:21228911`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A14,B131,B37,B51,C55,C87
`Chr1:21228927`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B65
`Chr1:21228927`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B65
`Chr1:21229002`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	44	A1,A20,A4,A8,B10,B105,B109,B112,B119,B133,B17,B25,B27,B34,B4,B40,B45,B47,B52,B58,B59,B61,B64,B73,B74,B80,B84,B85,B94,B95,C17,C21,C28,C29,C3,C33,C36,C52,C6,C65,C73,C78,C8,D5
`Chr1:21229008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:21229011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922317.1
ATGAAAGGCGGTGCGAGGTCGGGTGGTGGCGCTGCGCGAAAGGGGGCGCAAACCCTAGTGAGGTGTGAGGTCGGCGACGCGAGATCTGGGGAAGAAGAAGATTTTTTGAGGGAGAATAAGTCGACGGCGGCGATGGATGTTTGGGGAAGAAGAAGAACGGCGCGAGGTTTGTGGTGGACGGCGGCGGTGGAGAGTGCAGAGTTGCCAGAGGCAGCTCTGCCGACTCTGTCCGACTCAGCTTTGCCCCGACTCTACGACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997001
ATGAAAGGCGGTGCGAGGTCGGGTGGTGGCGCTGCGCGAAAGGGGGCGCAAACCCTAGTGAGGTGTGAGGTCGGCGACGCGAGATCTGGGGAAGAAGAAGATTTTTTGAGGGAGAATAAGTCGACGGCGGCGATGGATGTTTGGGGAAGAAGAAGAACGGCGCGAGGTTTGTGGTGGACGGCGGCGGTGGAGAGTGCAGAGTTGCCAGAGGCAGCTCTGCCGACTCTGTCCGACTCAGCTTTGCCCCGACTCTACGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778300.1
MKGGARSGGGAARKGAQTLVRCEVGDARSGEEEDFLRENKSTAAMDVWGRRRTARGLWWTAAVESAELPEAALPTLSDSALPRLYDSALPTLLCRICSALPTPPLHATSAQYYHVGDRSAWYYHRETEPEDCITSNCSEIPQWSYEANWIIAHGSLESSVTVESSDDPIAEPDPENTASKFPLILKPRSPDSGHCEIKICFKQKYEVGQIYVRSTARAYEIYYATSPHCINEYLSTVRCGVAERGDKVLETCCVEDVAEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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