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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001025`

染色体: Chr01 坐标: 21400107-21402485 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001025`
名称	SmilChr01G001025
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21400107 - 21402485 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006974`
GeneID	`131006974`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006974`
原始查询	`SmilChr01G001025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=30.4; qcov=0.807; evalue=1.47e-84; confidence=low
Rice	`Os03g0164400` - identity=29.5; qcov=0.783; evalue=1.82e-72; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006974

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790097.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790097.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790097.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790097.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790097.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21400238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B70,C83,D2
`Chr1:21400247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C77,D11,D6
`Chr1:21400250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:21400283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,A23
`Chr1:21400363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr1:21400380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr1:21400458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:21400483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:21400502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:21400519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C87
`Chr1:21400524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr1:21400548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790097.1

710 aa

355

710

FAR1

MULE

PF03101 FAR1 26-119 aa PF10551 MULE 241-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790097.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	26	119	1.8e-18	67.7	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057790097.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	241	333	2.4e-26	92.7	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934114.1
AACAAGGACAAGACAACCAATCTCAAACATATATGCCTATAGCTGATGACGTTTCCAGGCTGCCATATGTAGGGCAAGTGTTCAGTTCTTTAGACGAGGCATTTGACTTATATGGATTGTATGGATATTCATGTGGGTTCGATGTCCGCAAAGGCACGACCAGGAAAGGCAAATATGGTCAGATAATATATCAAACATTTGTTTGTGTCAGGGAAGGAATTAACCCGGGTACCAATGATGAGCATGCAGAGACGCAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006974
ATGCCTATAGCTGATGACGTTTCCAGGCTGCCATATGTAGGGCAAGTGTTCAGTTCTTTAGACGAGGCATTTGACTTATATGGATTGTATGGATATTCATGTGGGTTCGATGTCCGCAAAGGCACGACCAGGAAAGGCAAATATGGTCAGATAATATATCAAACATTTGTTTGTGTCAGGGAAGGAATTAACCCGGGTACCAATGATGAGCATGCAGAGACGCAATCAAAAACTAAAAAGAGGCGACGTAAACCATCTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790097.1
MPIADDVSRLPYVGQVFSSLDEAFDLYGLYGYSCGFDVRKGTTRKGKYGQIIYQTFVCVREGINPGTNDEHAETQSKTKKRRRKPSTRCDCRANVIMKRRDNGEYYVSVFNEAHNHELISEDCRHFMKYNRKVDSSHQLILLKCAKVNIGLMRAFRLFKELVGGYEYVGCTSNDFKKFSYQMNSYPDGSDAQLLLDRLITNHDLDDQFKVEYLLDECQKVKSIFWSDAIGVQNYNIFGDSVSFDATYTTNRYSMIFVPFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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