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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001037`

染色体: Chr01 坐标: 21558355-21565856 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001037`
名称	SmilChr01G001037
描述	uncharacterized SmilChr01G001037
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21558355 - 21565856 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006985`
GeneID	`131006985`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006985`
原始查询	`SmilChr01G001037`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rRNA processing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836254]; symbol=AT5G61330; hit=AT5G61330; species=arabidopsis; confidence=high
产物	rRNA processing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836254]; symbol=AT5G61330; hit=AT5G61330; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G61330` (AT5G61330) rRNA processing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836254] identity=62.2; qcov=0.887; evalue=2.32e-149; confidence=high
Rice	`Os01g0526200` - identity=56.9; qcov=0.797; evalue=6.57e-124; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	-
Pfam	PF08164 (TRAUB); PF13339 (AATF-Che1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790114.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057790114.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057790114.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790114.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790114.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21563031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,C9
`Chr1:21564168`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A2
`Chr1:21564168`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A2
`Chr1:21564235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C17
`Chr1:21564269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790114.1

410 aa

205

410

AATF-Che1

TRAUB

PF13339 AATF-Che1 110-245 aa PF08164 TRAUB 324-399 aa

XP_057790115.1

408 aa

204

408

AATF-Che1

TRAUB

PF13339 AATF-Che1 110-243 aa PF08164 TRAUB 322-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790114.1`	Pfam	`PF13339`	AATF-Che1	Family	110	245	1.2e-31	110.8	Apoptosis antagonizing transcription factor
`XP_057790114.1`	Pfam	`PF08164`	TRAUB	Domain	324	399	3.2e-21	76.2	Apoptosis-antagonizing transcription factor, C-terminal
`XP_057790115.1`	Pfam	`PF13339`	AATF-Che1	Family	110	243	2.3e-30	106.7	Apoptosis antagonizing transcription factor
`XP_057790115.1`	Pfam	`PF08164`	TRAUB	Domain	322	397	3.2e-21	76.3	Apoptosis-antagonizing transcription factor, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934131.1
CTAATGACTATCTACTCACGCAAATTTTCCTAATTTCTAACCCTAACCCAAATTTCATAATTTTTCAATTTTCATCTAATTTCTCTCTCACTCCCATCTCACGCGGCCTCCCCCGACCCCCAAACCCAGAAATCGCCTCCCCCACCCCCAGTCCAGACCGGCGAGACGCGCTCCAGTCTGCCTCCAGGCCTGCCGCAGCTGCTCTCCACTCCTGCGAAACCAAGCCTTCAGGCCCACCGCAGCAGCCCTCCAGTCCGGCG...

XM_057934132.1
TAACCCAAATTTCATAATTTTTCAATTTTCATCTAATTTCTCTCTCACTCCCATCTCACGCGGCCTCCCCCGACCCCCAAACCCAGAAATCGCCTCCCCCACCCCCAGTCCAGACCGGCGAGACGCGCTCCAGTCTGCCTCCAGGCCTGCCGCAGCTGCTCTCCACTCCTGCGAAACCAAGCCTTCAGGCCCACCGCAGCAGCCCTCCAGTCCGGCGAGACCGCGCCTCCAGCCAGGCCCGCCGCAGCCGCCCTCCATTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006985
ATGGGGAAGAAGAAAGTGAGAAAGATGATGGAGATTGATAGTGACATGGGGTTGGACGAAGAAATGAACGATGGAGTTATGCTGATGGACAATGATGATGGCAATGAAGATGATTTTCATGATGAACATCATGACAGTGAGGAGGAAGATGAGGATGAAGAAGAGGATGATGGGGAGGAAGGCTCGGAAGAGGACAATGAGGAAGGAGAACATAGTGATGAAGATATTCAGAAAGGTGAGGAGCTGGATGAGCTGGAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790114.1
MGKKKVRKMMEIDSDMGLDEEMNDGVMLMDNDDGNEDDFHDEHHDSEEEDEDEEEDDGEEGSEEDNEEGEHSDEDIQKGEELDELEKEYRELQNQEQDIWRNLKRHTDEDIQKGQAVKNQRALWDKTLEFRFLLQKPFSSCNRLPEEQVKSLYCDADNEVSEAYSDLISSSKKTLDSILELQQALMTNNPSITRFEEANPVRDSKQLDVPGVSDGNIDEEWLQISQIQSRMNSFRNKSVDKWQRKTQVTTGSAAIKDKLH...

XP_057790115.1
MGKKKVRKMMEIDSDMGLDEEMNDGVMLMDNDDGNEDDFHDEHHDSEEEDEDEEEDDGEEGSEEDNEEGEHSDEDIQKGEELDELEKEYRELQNQEQDIWRNLKRHTDEDIQKGQAVKNQRALWDKTLEFRFLLQKPFSSCNRLPEVKSLYCDADNEVSEAYSDLISSSKKTLDSILELQQALMTNNPSITRFEEANPVRDSKQLDVPGVSDGNIDEEWLQISQIQSRMNSFRNKSVDKWQRKTQVTTGSAAIKDKLHAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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