当前解析结果
SmilChr01G001038| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001038 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001038 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001038 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 21607331 - 21608758 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997771 |
|---|---|
| GeneID | 130997771 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997771 |
| 原始查询 | SmilChr01G001038 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=27.5; qcov=0.461; evalue=1.3e-08; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997771 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057779214.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057779214.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057779214.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779214.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779214.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:21607350 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr1:21607362 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr1:21607373 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B105,B81,C35,C42,C6 |
Chr1:21607378 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B27,B69 |
Chr1:21607398 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C39,C60 |
Chr1:21607402 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,B8 |
Chr1:21607413 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B27,B69,B73 |
Chr1:21607433 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B121,B64 |
Chr1:21607448 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B6,C85 |
Chr1:21607462 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B105 |
Chr1:21607482 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,B62,B91,C14 |
Chr1:21607484 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B105 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。