当前解析结果
SmilChr01G001051| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001051 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001051 |
| 描述 | noroxomaritidine synthase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 21851848 - 21861070 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006996 |
|---|---|
| GeneID | 131006996 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006996 |
| 原始查询 | SmilChr01G001051 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | noroxomaritidine synthase-like |
| 产物 | noroxomaritidine synthase-like |
| Arabidopsis | AT2G23180 (CYP96A1)cytochrome P450, family 96, subfamily A, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816850] identity=43; qcov=1.02; evalue=2.04e-136; confidence=medium |
| Rice | Os03g0140100 (MAH1)- identity=42.3; qcov=0.988; evalue=1.32e-128; confidence=medium |
| GO | GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00067 (p450) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006996 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057790127.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057790127.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057790127.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790127.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790127.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:21856946 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr1:21857033 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr1:21857194 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 44 | A1,A14,A21,A24,A4,A5,B100,B11,B122,B132,B133,B136,B21,B27,B30,B31,B34,B45,B47,B52,B56,B58,B68,B80,B81,B93,B94,B96,C12,C29,C31,C32,C33,C36,C42,C47,C5,C52,C58,C65,C68,C80,D1,D2 |
Chr1:21857206 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,B140,C50 |
Chr1:21857241 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B118,B32,C54,C66 |
Chr1:21860787 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A20 |
Chr1:21860787 |
G |
GT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | A20 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057790127.1PF00067
p450 27-474 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057790127.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 27 | 474 | 5.1e-37 | 128.4 | Cytochrome P450 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。