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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001064`

染色体: Chr01 坐标: 21997676-21998775 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001064`
名称	SmilChr01G001064
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 25-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21997676 - 21998775 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007008`
GeneID	`131007008`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007008`
原始查询	`SmilChr01G001064`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 25-like
产物	AT-hook motif nuclear-localized protein 25-like
Arabidopsis	`AT1G76500` (SOB3) Putative AT-hook DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843983] identity=54.1; qcov=0.611; evalue=4.57e-27; confidence=medium
Rice	`Os02g0713700` - identity=56.7; qcov=0.575; evalue=4.3e-26; confidence=medium
GO	GO:0003680 (minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0010228 (vegetative to reproductive phase transition of meristem)
KEGG	-
Pfam	PF03479 (PCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007008

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790132.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057790132.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057790132.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790132.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21997881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:21997890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:21997910`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B71,B73,C72
`Chr1:21997910`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B71,B73,C72
`Chr1:21997984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C42
`Chr1:21998029`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B2,C27,C37,C43,C86,C9
`Chr1:21998082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr1:21998107`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C75
`Chr1:21998107`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C75
`Chr1:21998108`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B115,B2,B53,B75,B83,C27,C37,C43,C86,D9
`Chr1:21998112`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A14,A8,B119,C3,C74,D8
`Chr1:21998165`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B75,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790132.1

221 aa

110

221

PCC

PF03479 PCC 2-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790132.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	2	114	3.5e-12	47.1	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934149.1
CTTGAGCCTTTGTCTATTTATAATAGGGATAAGGGCCAAATACCTCTTAGGGTTTACCCCAAAAATCAGATATTTGCATTCGACCTTCACCATGAATTCTCGGAAATGGGTCAACTAAACCCTTCCATCAGGAACACAAGCACCGTCTGAATTTTTTTATTTTTTTAAAATTTCTGTGGATCACAAACTCGTTGGACGCAGTGATGCTGCGCTCGCACATGCTGGAGGTCTCGTCGGGGGGGACACCAAGAACGTCTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007008
ATGCTGCGCTCGCACATGCTGGAGGTCTCGTCGGGGGGGACACCAAGAACGTCTCTTATGTACGTGCCCCTCCGCAGGAGAGGCGTCTGCGAGCTCAGCAGCGGCGGCGGCACCGTCACCAATGTCGTGCCCCACCAGCCGTGGGCAGGGGCCCCGAGGGCTGTGGTGATGCTGCACGGCTGCTTTGAGATCCTCTCCCTCACCGGGACAGTGCTGTCGTCGCCGGGGCTGGGGGGGGGGATCTTGATTTCCTTATCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790132.1
MLRSHMLEVSSGGTPRTSLMYVPLRRRGVCELSSGGGTVTNVVPHQPWAGAPRAVVMLHGCFEILSLTGTVLSSPGLGGGILISLSLGQGQAVGGSLVVPLVVSGTVVLMAVSFANAVFERLPLEVGGAITAAQLQPSVLQSSGAGGSGQGGHMGESGGGGGGGGDGSFLNSGGGGWGNATPLWNYLFSAEHFGWGSSGSSSRGSGRPPFLLDGRVWSTHF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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