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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001065`

染色体: Chr01 坐标: 22002683-22007546 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001065`
名称	SmilChr01G001065
描述	protein CHAPERONE-LIKE PROTEIN OF POR1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22002683 - 22007546 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007009`
GeneID	`131007009`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007009`
原始查询	`SmilChr01G001065`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CHAPERONE-LIKE PROTEIN OF POR1, chloroplastic-like
产物	protein CHAPERONE-LIKE PROTEIN OF POR1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G23040` (CDF1) cell growth defect factor-like protein (DUF3353) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832368] identity=72.2; qcov=0.854; evalue=1.84e-116; confidence=high
Rice	`Os09g0380200` (OsV5A) - identity=64.1; qcov=0.783; evalue=1.6e-91; confidence=high
GO	GO:0031969 (chloroplast membrane)
KEGG	-
Pfam	PF11833 (CPP1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007009

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057790133.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057790133.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057790134.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790133.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790133.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22002872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C9
`Chr1:22002873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,C44
`Chr1:22005833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,B98,C42,D5
`Chr1:22005841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B140,C79,D7
`Chr1:22006060`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B129,B15
`Chr1:22006060`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B129,B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790133.1

265 aa

132

265

CPP1-like

PF11833 CPP1-like 85-264 aa

XP_057790134.1

253 aa

126

253

CPP1-like

PF11833 CPP1-like 73-252 aa

XP_057790135.1

253 aa

126

253

CPP1-like

PF11833 CPP1-like 73-252 aa

XP_057790136.1

253 aa

126

253

CPP1-like

PF11833 CPP1-like 73-252 aa

XP_057790137.1

253 aa

126

253

CPP1-like

PF11833 CPP1-like 73-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790133.1`	Pfam	`PF11833`	CPP1-like	Family	85	264	3.7e-59	200.4	Protein CHAPERONE-LIKE PROTEIN OF POR1-like
`XP_057790134.1`	Pfam	`PF11833`	CPP1-like	Family	73	252	3.4e-59	200.5	Protein CHAPERONE-LIKE PROTEIN OF POR1-like
`XP_057790135.1`	Pfam	`PF11833`	CPP1-like	Family	73	252	3.4e-59	200.5	Protein CHAPERONE-LIKE PROTEIN OF POR1-like
`XP_057790136.1`	Pfam	`PF11833`	CPP1-like	Family	73	252	3.4e-59	200.5	Protein CHAPERONE-LIKE PROTEIN OF POR1-like
`XP_057790137.1`	Pfam	`PF11833`	CPP1-like	Family	73	252	3.4e-59	200.5	Protein CHAPERONE-LIKE PROTEIN OF POR1-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934150.1
CTGAACTCCAAGTTTCCAACTCCTCCCTTCCTACCCGCCGCTCCTCTCCCTTCCAGGCTCTAGCCTCTGACTTGACTCACCTTCCACTCTTCTGCCCTCCGCCGGTCGTCGGCTCATCTCCGACTCGCCTGCAACTCCAAGACCAAAAGCCTGCGTCGCCGCGACAGCCCAAGTGGACAGGCCCGTCACCCGACTCACCCCTTCCGCGACTCGCCTGCCCTCTGCCACTCCGGTCCGCGTCGCCAACAGCCCAGACTCGG...

XM_057934154.1
TGAACTCCAAGTTTCCAACTCCTCCCTTCCTACCCGCCGCTCCTCTCCCTTCCAGGCTCTAGCCTCTGACTTGACTCACCTTCCACTCTTCTGCCCTCCGCCGGTCGTCGGCTCATCTCCGACTCGCCTGCAACTCCAAGACCAAAAGCCTGCGTCGCCGCGACAGCCCAAGTGGACAGGCCCGTCACCCGACTCACCCCTTCCGCGACTCGCCTGCCCTCTGCCACTCCGGTCCGCGTCGCCAACAGCCCAGACTCGGC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131007009
ATGAGAAAGAGGAGGGACTCGGATCTTGAGAACCTAATGGCAGCGGCTCTCCTCTCAACCCCTACCCTCAAAACCTCTTTCCTTGGCCGTCGTCTTCACAGTTCAATTCGAGGCGATTCGAGAAGAAGTAACCCGGGCTATGTGGGATTTATCTCCCCAAAATGTGCAGTGGATACGCCTTATGAAGGTAGCATTTCAAAATTCCCTAGGTTAAATGTGTGGGATCCTTATAAGCGGCTGGGGGTTAGTACTGATGCTTC...

LOC131007009
ATGGCAGCGGCTCTCCTCTCAACCCCTACCCTCAAAACCTCTTTCCTTGGCCGTCGTCTTCACAGTTCAATTCGAGGCGATTCGAGAAGAAGTAACCCGGGCTATGTGGGATTTATCTCCCCAAAATGTGCAGTGGATACGCCTTATGAAGGTAGCATTTCAAAATTCCCTAGGTTAAATGTGTGGGATCCTTATAAGCGGCTGGGGGTTAGTACTGATGCTTCGGAAGAAGAAGTTTGGAGTGCTCGGAACTTTTTGTT...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057790133.1
MRKRRDSDLENLMAAALLSTPTLKTSFLGRRLHSSIRGDSRRSNPGYVGFISPKCAVDTPYEGSISKFPRLNVWDPYKRLGVSTDASEEEVWSARNFLLDQYANHERSAESIEAAFEKLLMTSYKNRKKMKINLKSRLKKKVEESPPWVKNLLSFVEIPPPVIILRRLFLFSFMACWSVMNSAEAGPAFQVALSLGACIYFLNDKNKSLPRAAIIGFGALVAGWFCGSMTVPLVPSFLLQPTWTLELLTSLVVYVFLFLA...

XP_057790134.1
MAAALLSTPTLKTSFLGRRLHSSIRGDSRRSNPGYVGFISPKCAVDTPYEGSISKFPRLNVWDPYKRLGVSTDASEEEVWSARNFLLDQYANHERSAESIEAAFEKLLMTSYKNRKKMKINLKSRLKKKVEESPPWVKNLLSFVEIPPPVIILRRLFLFSFMACWSVMNSAEAGPAFQVALSLGACIYFLNDKNKSLPRAAIIGFGALVAGWFCGSMTVPLVPSFLLQPTWTLELLTSLVVYVFLFLACSFLK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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