当前解析结果
SmilChr01G001068| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001068 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001068 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001068 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 22024948 - 22026138 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007011 |
|---|---|
| GeneID | 131007011 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007011 |
| 原始查询 | SmilChr01G001068 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007011 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790139.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057790139.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057790139.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790139.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790139.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:22025207 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B22,B33,B83,C15,C52 |
Chr1:22025209 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B42,B65,C50 |
Chr1:22025218 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,B91 |
Chr1:22025231 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B7,C11,C69 |
Chr1:22025253 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B108,B131 |
Chr1:22025271 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B108,B131 |
Chr1:22025272 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B108,B131 |
Chr1:22025287 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,B125 |
Chr1:22025301 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 17 | A22,A5,B102,B110,B21,B76,B91,B93,C10,C18,C30,C38,C39,C59,C63,C87,D2 |
Chr1:22025318 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 43 | A16,A21,B110,B128,B136,B2,B26,B34,B37,B43,B47,B55,B57,B67,B71,B72,B8,B85,B89,B9,B92,B94,B97,C10,C11,C19,C20,C21,C3,C32,C49,C53,C60,C62,C63,C68,C72,C80,C84,C85,C87,D11,D2 |
Chr1:22025322 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C42 |
Chr1:22025367 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,B125,C70 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。