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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001091`

染色体: Chr01 坐标: 22363421-22371155 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001091`
名称	SmilChr01G001091
描述	uncharacterized SmilChr01G001091
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22363421 - 22371155 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007027`
GeneID	`131007027`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007027`
原始查询	`SmilChr01G001091`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PHD finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819993]; symbol=AT3G08020; hit=AT3G08020; species=arabidopsis; confidence=high
产物	PHD finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819993]; symbol=AT3G08020; hit=AT3G08020; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G08020` (AT3G08020) PHD finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819993] identity=52.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0527800` - identity=43.3; qcov=0.868; evalue=0; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007027

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790162.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790162.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790162.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790162.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790162.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22366018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B125,B90,B92,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790162.1

844 aa

422

844

PHD

PF00628 PHD 198-241 aa

XP_057790163.1

843 aa

422

843

PHD

PF00628 PHD 197-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790162.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	198	241	4.6e-15	56.1	PHD-finger
`XP_057790163.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	197	240	4.6e-15	56.1	PHD-finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934180.1
AATATTTCACCAACCTCGTCTCTTTCTATCTCTCTCCTCCCCAAATTTCTTTTCGAATTTCTGATTATTTTTTTCCCAATCAACCAAAAGAATTAAAGTTAATTTTTTCTCCATAACACCGTTCGCTTAAACACTCAAAATAAATAAAATTTCCCCCCATTTTTCCTCGTGTAATTATGGCCTTTCATGTTGCTTGCCCAATTACCTGCCGGAAAATATGTTTCTGTGCGTTGGGATTTGCTGGGCCGCTGCGGAGCGAG...

XM_057934179.1
CTCTCTCCTCCCCAAATTTCTTTTCGAATTTCTGATTATTTTTTTCCCAATCAACCAAAAGAATTAAAGTTAATTTTTTCTCCATAACACCGTTCGCTTAAACACTCAAAATAAATAAAATTTCCCCCCATTTTTCCTCGTGTAATTATGGCCTTTCATGTTGCTTGCCCAATTACCTGCCGGAAAATATGTTTCTGTGCGTTGGGATTTGCTGGGCCGCTGCGGAGCGAGAAGGGGAAAGAAGATTTTTTGAAGGAGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007027
ATGGCCTTTCATGTTGCTTGCCCAATTACCTGCCGGAAAATATGTTTCTGTGCGTTGGGATTTGCTGGGCCGCTGCGGAGCGAGAAGGGGAAAGAAGATTTTTTGAAGGAGGTTGCTAGGGTTGAGCTATTCTTGAAGGACCCGTGGTTGATCAAGGCCAAGGAGAATGCGACCATTCAGGTTAAAGTCCCCAAAGTTTCTGTTTCTCCCGCCTTGCCACCTCCAGCGCCCCAATTGGCGGCGGATGTGGCTGGAGTTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790162.1
MAFHVACPITCRKICFCALGFAGPLRSEKGKEDFLKEVARVELFLKDPWLIKAKENATIQVKVPKVSVSPALPPPAPQLAADVAGVGGEEASAQVKRAALQKQAAAASLVAEDYARRFESGDLEQAKDAAGEEQGLSTAKVMCRICFSGENDESERARKMLSCNSCGKKYHRNCLKAWSQNRDLFHWSSWTCPSCRTCEVCRRTGDPNKFMFCKRCDGAYHCYCQQPPHKNVGHGPYLCPKHTKCHSCDSTVPGNGLSVR...

XP_057790163.1
MAFHVACPITCRKICFCALGFAGPLRSEKGKEDFLKEVARVELFLKDPWLIKAKENATIQVKVPKVSVSPALPPPAPQLAADVAGVGGEEASAQVKRAALQKQAAAASLVAEDYARRFESGDLEAKDAAGEEQGLSTAKVMCRICFSGENDESERARKMLSCNSCGKKYHRNCLKAWSQNRDLFHWSSWTCPSCRTCEVCRRTGDPNKFMFCKRCDGAYHCYCQQPPHKNVGHGPYLCPKHTKCHSCDSTVPGNGLSVRW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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