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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001093`

染色体: Chr01 坐标: 22379723-22397006 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001093`
名称	SmilChr01G001093
描述	uncharacterized SmilChr01G001093
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22379723 - 22397006 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999742`
GeneID	`130999742`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999742`
原始查询	`SmilChr01G001093`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834845]; symbol=AT5G47940; hit=AT5G47940; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	40S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834845]; symbol=AT5G47940; hit=AT5G47940; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G47940` (AT5G47940) 40S ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834845] identity=45.6; qcov=0.915; evalue=1.67e-40; confidence=medium
Rice	`Os07g0569000` - identity=41.5; qcov=0.96; evalue=6.95e-33; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999742

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781382.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057781382.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057781382.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057781382.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781382.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22395267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C39
`Chr1:22395272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B117,B118,B66,B82,C62
`Chr1:22395272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B118,B66,B82,C62
`Chr1:22395371`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B15
`Chr1:22395371`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B15
`Chr1:22395404`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A11,A21,B1,B11,B113,B120,B122,B136,B31,B41,B62,B68,B7,B71,B8,B81,B95,C30,C32,C34,C42,C48,C58,C64,C68
`Chr1:22395453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C50
`Chr1:22395472`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B110,C50
`Chr1:22395472`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B110,C50
`Chr1:22396424`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C83
`Chr1:22396424`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C83
`Chr1:22396461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925399.1
ATGGAAACTCAAGTATGTTTTGAGCAAAAGTATGAGGTTGGGCAAATATATGTTCGGAGCACTGCTCGTGCATATGAGATCTATTATGCAACTTCTCCTCATAGTATCAACGAGTATCTGTCTACTGTTCGGTGTGGTGTTGCTGAACGAGGTGACAAAGTTCTCGAGACCTGTTGTGTTGAAGATGTTGCCGAGGAGCATGGGAAGTCTTTATCAGGAGACGTAACTGCAGAAACTGCTTCAAGTGGAGGAAGTGCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999742
ATGGAAACTCAAGTATGTTTTGAGCAAAAGTATGAGGTTGGGCAAATATATGTTCGGAGCACTGCTCGTGCATATGAGATCTATTATGCAACTTCTCCTCATAGTATCAACGAGTATCTGTCTACTGTTCGGTGTGGTGTTGCTGAACGAGGTGACAAAGTTCTCGAGACCTGTTGTGTTGAAGATGTTGCCGAGGAGCATGGGAAGTCTTTATCAGGAGACGTAACTGCAGAAACTGCTTCAAGTGGAGGAAGTGCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781382.1
METQVCFEQKYEVGQIYVRSTARAYEIYYATSPHSINEYLSTVRCGVAERGDKVLETCCVEDVAEEHGKSLSGDVTAETASSGGSAATSEDDWVKIKVPGTGSSPASDKTDTNGLNNIQDLYEATAQISDSEPCLSLTIRLLSLQDKGHVYVDEIYVFVDPVESTDSGNGAASAGGLTQSSLMANPSAVIKIGCKPSSRKI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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