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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001100`

染色体: Chr01 坐标: 22528656-22530377 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001100`
名称	SmilChr01G001100
描述	uncharacterized SmilChr01G001100
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22528656 - 22530377 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999817`
GeneID	`130999817`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999817`
原始查询	`SmilChr01G001100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=26.4; qcov=0.369; evalue=3.39e-20; confidence=low
Rice	`Os09g0268800` - identity=25; qcov=0.374; evalue=9.26e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999817

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781497.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057781497.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057781497.1`
4	P-body	P-body	0.40000	`XP_057781497.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781497.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22528663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:22528741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:22528749`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A19,A24,A5,A9,B100,B117,B126,B135,B140,B22,B23,B44,B46,B89,B9,B93,C17,C44,C53,C64,C76,C78,D2
`Chr1:22528750`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A19,A24,A5,A9,B100,B117,B126,B135,B140,B22,B23,B44,B46,B89,B9,B93,C17,C44,C53,C64,C76,C78,D2
`Chr1:22528753`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A19,A24,A5,A9,B100,B117,B126,B135,B140,B22,B23,B44,B46,B89,B9,B93,C17,C44,C53,C64,C76,C78,D2
`Chr1:22528756`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A19,A24,A5,A9,B100,B117,B126,B135,B140,B22,B23,B44,B46,B89,B9,B93,C17,C44,C53,C64,C76,C78,D2
`Chr1:22528759`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	70	A11,A14,A16,A18,A20,A21,A23,A3,A4,B102,B107,B110,B114,B117,B122,B127,B128,B137,B139,B15,B16,B17,B22,B3,B30,B34,B37,B38,B39,B42,B46,B48,B51,B52,B59,B61,B63,B65,B68,B7,B8,B9,B90,C15,C2,C24,C26,C28,C30,C31,C38,C42,C44,C45,C47,C5,C50,C54,C56,C64,C65,C70,C71,C72,C74,C82,C85,D1,D5,D9
`Chr1:22528791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C5,C75
`Chr1:22528803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr1:22528810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B70
`Chr1:22528839`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A20,B103,B130,B132,B137,B27,B30,B32,B36,B49,B73,B79,B96,C19,C30,C56,C75,C81
`Chr1:22528867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C56,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781497.1

545 aa

272

545

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 272-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781497.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	272	314	9.8e-07	29.0	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925514.1
ATGGACTCCGGTCGCTTGCCTCATGGCGATCATGATCGGTCGGCGTTGAACCTTCCTATTATTTCCAACAATTTCACTAGATCTTCCCCAGCGAAGTCGTCAAAATTTGAAGTCCCTACTGGTGATGAGAAAAACCCTAGTGGTATCGATAAGACAGTCATGGTGGAGGAGGGTGTTCCCACCAGCGCGAAAGAGGCTCCAATCTCCTCTTCAGGGAAGACAAATACTATGAATTATGCTGCTGCTTTAGGTCCACGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999817
ATGGACTCCGGTCGCTTGCCTCATGGCGATCATGATCGGTCGGCGTTGAACCTTCCTATTATTTCCAACAATTTCACTAGATCTTCCCCAGCGAAGTCGTCAAAATTTGAAGTCCCTACTGGTGATGAGAAAAACCCTAGTGGTATCGATAAGACAGTCATGGTGGAGGAGGGTGTTCCCACCAGCGCGAAAGAGGCTCCAATCTCCTCTTCAGGGAAGACAAATACTATGAATTATGCTGCTGCTTTAGGTCCACGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781497.1
MDSGRLPHGDHDRSALNLPIISNNFTRSSPAKSSKFEVPTGDEKNPSGIDKTVMVEEGVPTSAKEAPISSSGKTNTMNYAAALGPRVRKPDLPAHRFQALHTSSSGGIDTLKIPSDFLQQRVMEFKFALIGRLMLRKGSKPRLTQDLKAELQKFWNTSQEWQLIPMGKGFFTLKFSSMADKKVAKEKLNLDISNGCLRLREWVPKFDPYKECSLLAQVWVRIYYLPIELWHPEVIAAVGRYLGNPIRIDGGSADRDVGHY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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