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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001113`

染色体: Chr01 坐标: 22737791-22741754 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001113`
名称	SmilChr01G001113
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22737791 - 22741754 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000536`
GeneID	`131000536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000536`
原始查询	`SmilChr01G001113`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=34.2; qcov=0.76; evalue=2.15e-72; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=30.7; qcov=0.756; evalue=1.01e-60; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782532.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057782532.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782532.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782532.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782532.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22737797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:22737813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C44,C71
`Chr1:22737880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B125,B70,C28,C52
`Chr1:22737902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B19
`Chr1:22737919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A13,A22,A7,A9,B109,B113,B115,B137,B14,B140,B47,B60,B61,B64,B65,B66,B71,B76,B8,B80,B82,B98,C1,C15,C23,C24,C40,C46,C55,C58,C59,C68,C74,C78,C82,C87
`Chr1:22737922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B84,D7
`Chr1:22737932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B2,B71,C62,C78
`Chr1:22739829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr1:22739830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:22739838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B72,C31
`Chr1:22739885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B77,B83,B89,C15
`Chr1:22739908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B65,B71,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782532.1

578 aa

289

578

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 73-183 aa PF10551 MULE 103-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782532.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	73	183	6.1e-07	30.1	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057782532.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	103	195	1.7e-26	93.1	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926549.1
ATGATGATGCTTATTGGAATGAAAGCGAATATCGGGCCTATGAAGACATTTAGATTTTATAAGGAACTAGTCGGTGGATACGATGATGTGGGCTGTACTGCACAAGATTTCAAGAATTATGGTCGTGACCTAAGGGCGTTTTCCGATGGAGTTGATGCCCGCATATTATTAGATAATTTCAGGGATAAACAAGAGAGTTGTCCAGGTTTTAAGTTCTCCTTTGATACATTTGAAGATACTACATTGAAGAGACTGTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000536
ATGATGATGCTTATTGGAATGAAAGCGAATATCGGGCCTATGAAGACATTTAGATTTTATAAGGAACTAGTCGGTGGATACGATGATGTGGGCTGTACTGCACAAGATTTCAAGAATTATGGTCGTGACCTAAGGGCGTTTTCCGATGGAGTTGATGCCCGCATATTATTAGATAATTTCAGGGATAAACAAGAGAGTTGTCCAGGTTTTAAGTTCTCCTTTGATACATTTGAAGATACTACATTGAAGAGACTGTTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782532.1
MMMLIGMKANIGPMKTFRFYKELVGGYDDVGCTAQDFKNYGRDLRAFSDGVDARILLDNFRDKQESCPGFKFSFDTFEDTTLKRLFWADDCSIKNFKLYGDAVSYDATYRTNKYKLIFTPFTGRDNHGRCITFGVVFISNEDVESYSWVFSKFVESMGAHPLILITDQDPAMRKAIENVLPNTSHRLCMWHILMKFAEKLPNHLMKDSELKEKFNNIVWPDLVEPSDFEEKWHCLMDEYDLGGNRWFTDMFALRANWVPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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