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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001123`

染色体: Chr01 坐标: 22840854-22842220 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001123`
名称	SmilChr01G001123
描述	chaperonin-like RbcX protein 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22840854 - 22842220 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007050`
GeneID	`131007050`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007050`
原始查询	`SmilChr01G001123`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperonin-like RbcX protein 2, chloroplastic
产物	chaperonin-like RbcX protein 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G19855` (RbcX2) Chaperonin-like RbcX protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832106] identity=50; qcov=0.981; evalue=2.68e-62; confidence=high
Rice	`Os07g0569600` - identity=58.5; qcov=0.625; evalue=1.23e-55; confidence=high
GO	GO:0044183 (protein folding chaperone); GO:0110102 (ribulose bisphosphate carboxylase complex assembly)
KEGG	-
Pfam	PF02341 (RbcX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007050

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057790177.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057790177.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057790177.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790177.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790177.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22841255`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A11,A18,A2,B124,B15,B16,B41,B47,B66,B7,B75,B82,B94,C22,C30,C35,C42,C5,C67,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790177.1

208 aa

104

208

RbcX

PF02341 RbcX 91-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790177.1`	Pfam	`PF02341`	RbcX	Family	91	192	4.9e-18	66.1	RbcX protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934194.1
CTCTGCTCCATTCATGTGAGATATGACAAAACAAGAATTAGTATTGTGGAGAATTTGGGACCTCACAAATATTTGAAAAAAAAAACACACACACACACACAAGGAAAACATTGTCTATAATTCACATAAATATCTGAACTTGAAGCCAGATTCTTGAAGATAAATCAAAGAGGCAGAAGATTTTTTTTTTGTTTTGTTAGAATCTTTCTCCAGGTGGCGCCTTGCTCAGAATTATCTCTACAGTTCATTTGACAGCAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007050
ATGGGTGAATCATGGGCATGTTTATGCGTGGACAGCATCATGCCTTCAACCATAAAGGGAAACAACTGTGTCTCTTATTTCTACAGAAACGTAGGGAAAAGAAGGCAATTGCAGCAGCAACAGCAGAGGATGGTGCATTTGAGCAATTCTTTCTTGGATCCATGGCCTGCAAAAATGGTGTCAATCTGCACTAGTTCAACAAAGAGACACAAGCTTCAACGCCTCATCGTTGTGGATGAACTAGGGGGGCAATACGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790177.1
MGESWACLCVDSIMPSTIKGNNCVSYFYRNVGKRRQLQQQQQRMVHLSNSFLDPWPAKMVSICTSSTKRHKLQRLIVVDELGGQYEDTFNDVKMELVEFFTFKAVRTVLEQLYEMNPPQYKWFNNFVADNVPSKGNRFLQTLVKERRELAERVMITRLTLYGRWIKKCDLGEIYKEISDENLKLMRERLLETIQWPSDDNSKSDQDTD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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