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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001126`

染色体: Chr01 坐标: 22861750-22863588 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001126`
名称	SmilChr01G001126
描述	uncharacterized SmilChr01G001126
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22861750 - 22863588 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000850`
GeneID	`131000850`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000850`
原始查询	`SmilChr01G001126`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20167 (Retrotransp-rel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000850

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782989.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057782989.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782989.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782989.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782989.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22861797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B72,C14
`Chr1:22861827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B121
`Chr1:22861869`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B52,C9
`Chr1:22861869`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B52,C9
`Chr1:22861893`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A1,A14,A19,A22,B105,B111,B117,B121,B4,B47,B58,B71,B88,C14,C52,C59,C65,C75,C78,C9,D9
`Chr1:22861939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:22861949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:22861954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr1:22862025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A18
`Chr1:22862032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:22862081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:22862111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782989.1

612 aa

306

612

Retrotransp-rel

PF20167 Retrotransp-rel 396-558 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782989.1`	Pfam	`PF20167`	Retrotransp-rel	Domain	396	558	4.4e-25	89.3	Putative plant retrotransposon-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927006.1
ATGGACAAAAATCCTGATCTTTCCTCTCTCATCAAGAGTCTGATCCAACACTTCGGATCACCGGAAAGTGCAGCCAAACATCTCTCCGCCCTCCCTCAGATGGCTGAATCAACCGACAAACCCTCGTCTTCTCAAACTCCAGTGGAAGTCCCAGGAGGATCTTTTCCTCCAGCTCCTTCTCCAAAAGGCTCTCCGAAGAGAAGTACCACTGAGTCGTCTGTAGGGGCTGATGTTGATCCTGTCTCTTTGCAAATGGTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000850
ATGGACAAAAATCCTGATCTTTCCTCTCTCATCAAGAGTCTGATCCAACACTTCGGATCACCGGAAAGTGCAGCCAAACATCTCTCCGCCCTCCCTCAGATGGCTGAATCAACCGACAAACCCTCGTCTTCTCAAACTCCAGTGGAAGTCCCAGGAGGATCTTTTCCTCCAGCTCCTTCTCCAAAAGGCTCTCCGAAGAGAAGTACCACTGAGTCGTCTGTAGGGGCTGATGTTGATCCTGTCTCTTTGCAAATGGTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782989.1
MDKNPDLSSLIKSLIQHFGSPESAAKHLSALPQMAESTDKPSSSQTPVEVPGGSFPPAPSPKGSPKRSTTESSVGADVDPVSLQMVETPINPEPISTVPPLEGVYSKIAPGSSVKVDENLTKGKTSLPNLTVLATSEKSSGQPAFGVTQHQTPLPTPSEESIPSSKEESAHASQDTSMERIGEIAKEALLDLASQPGSDVDKASIVAEDECAAGDIPTSMDVDDPEKIPDVGQDVDPEESTDVIDVDTFVPDKKSRKRKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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