当前解析结果
SmilChr01G001148| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001148 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001148 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001148 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 23443102 - 23449748 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007068 |
|---|---|
| GeneID | 131007068 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007068 |
| 原始查询 | SmilChr01G001148 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | BET1P/SFT1P-like protein 14A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824986]; symbol=BS14A; hit=AT3G58170; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | BET1P/SFT1P-like protein 14A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824986]; symbol=BS14A; hit=AT3G58170; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G58170 (BS14A)BET1P/SFT1P-like protein 14A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824986] identity=63.4; qcov=0.35; evalue=2.58e-08; confidence=low |
| Rice | Os02g0820700 (P0474F11.16-2)- identity=61; qcov=0.35; evalue=5.45e-08; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007068 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057790197.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057790197.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057790194.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057790194.1 |
| 5 | Lipid droplet | 脂滴 | 0.20000 | XP_057790194.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:23449509 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,B127,B87,C38,D9 |
Chr1:23449611 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B118,B123,B31,B67,C18,C75 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
10 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。