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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001149`

染色体: Chr01 坐标: 23461383-23462529 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001149`
名称	SmilChr01G001149
描述	uncharacterized SmilChr01G001149
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	23461383 - 23462529 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131002510`
GeneID	`131002510`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131002510`
原始查询	`SmilChr01G001149`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=58.7; qcov=0.529; evalue=4.51e-68; confidence=medium
Rice	`Os08g0106900` - identity=42.6; qcov=0.933; evalue=1.48e-82; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131002510

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057784996.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057784996.1`
3	Telomere	端粒	0.60000	`XP_057784996.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057784996.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057784996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:23461383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,C16,C26,C78,D6
`Chr1:23461397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,C41,C45
`Chr1:23461403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr1:23461405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B61,C4
`Chr1:23461412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B67,C68
`Chr1:23461423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr1:23461427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B35,B97
`Chr1:23461429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B30,B51,C24
`Chr1:23461454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C73
`Chr1:23461482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B64,B89,C14
`Chr1:23461483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,D10
`Chr1:23461484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C44,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057784996.1

357 aa

178

357

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 2-83 aa PF01609 DDE_Tnp_1 113-270 aa PF13359 DDE_Tnp_4 119-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057784996.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	2	83	8.2e-21	74.4	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057784996.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	113	270	8.2e-11	42.7	Transposase DDE domain
`XP_057784996.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	119	280	8.6e-25	87.9	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057929013.1
ATGATGGATGGAGATCCGAGCCAGTTTCGACAGTTGTATAGAATGTATCCTGACGTCTTCATCAAATTATGCCAGATCATTAGGGAGAAAGCCCATGTGGATGATACACGATATACAACTGTTGAAGAAATGTTGGCAACATTCCTCATCATTGTAGGGCACAACGATCGCTATTGTAACGTTCATGAAAGGTTTGGTCGTTCGCATTTTGCTGCTAGTCAGAACTTCAACAAAATCTTGAGAGCATTGAACACCATAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131002510
ATGATGGATGGAGATCCGAGCCAGTTTCGACAGTTGTATAGAATGTATCCTGACGTCTTCATCAAATTATGCCAGATCATTAGGGAGAAAGCCCATGTGGATGATACACGATATACAACTGTTGAAGAAATGTTGGCAACATTCCTCATCATTGTAGGGCACAACGATCGCTATTGTAACGTTCATGAAAGGTTTGGTCGTTCGCATTTTGCTGCTAGTCAGAACTTCAACAAAATCTTGAGAGCATTGAACACCATAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057784996.1
MMDGDPSQFRQLYRMYPDVFIKLCQIIREKAHVDDTRYTTVEEMLATFLIIVGHNDRYCNVHERFGRSHFAASQNFNKILRALNTITPDMMVKPTGAIPAKIRESTRFYPYFKDCIGAIDGTHIPAMIRGKDVSYYRNRHGVNSQNVLAACNFDLQFIYVLSGWEGSAHDSKILSDALSRPNGLHVPQGKYFLVDCGFANRRQFLAPLRDVRYHLKDFGGEGRHPRNADELFNLRHASLRNVIECIFGIFKSRFTIFKTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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