Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G001194

染色体: Chr01 坐标: 24089992-24093764 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G001194
名称SmilChr01G001194
描述uncharacterized SmilChr01G001194
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向24089992 - 24093764 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131007109
GeneID131007109
locus_tag-
NCBI NameLOC131007109
原始查询SmilChr01G001194

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述reactive oxygen species modulator-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819982]; symbol=AT3G07910; hit=AT3G07910; species=arabidopsis; confidence=medium
产物reactive oxygen species modulator-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819982]; symbol=AT3G07910; hit=AT3G07910; species=arabidopsis; confidence=medium
ArabidopsisAT3G07910 (AT3G07910)
reactive oxygen species modulator-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819982]
identity=79.7; qcov=1; evalue=6.46e-27; confidence=medium
Rice-
-
GOGO:0005744 (TIM23 mitochondrial import inner membrane translocase complex); GO:0030150 (protein import into mitochondrial matrix); GO:0045039 (protein insertion into mitochondrial inner membrane)
KEGG-
PfamPF10247 (Romo1)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131007109

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Mitochondrion 线粒体 1.00000 XP_057790249.1
2 Mitochondrion membrane 线粒体膜 1.00000 XP_057790249.1
3 Mitochondrion inner membrane 线粒体内膜 1.00000 XP_057790249.1
4 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057790249.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057790249.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790249.1
74 aa
N
1
37
74
Romo1
C
PF10247 Romo1 5-70 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057790249.1 Pfam PF10247 Romo1 Family 5 70 1.2e-22 80.8 Reactive mitochondrial oxygen species modulator 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057934266.1
GTAATAGTTTGAAGAAAATCCGAGTGTTTTGAGCAATTTCTTTAATATTTCTGGGGCGAAAAGTAAAACATAACCTATTTATGAGTTGATGTCGTAGGCTCAAGTTTTATTCTGAAGAGCCAAAACACTTGTTCTCATCTGCGATAAATTGTAGAGAGAGAAAGATAGAGATATAAGAGAAGACATGGCAAGGGATAGCTGCCTCACACGAATTACGGCGGGCTTCGCCATCGGAGGCGCTGTCGGCGGCGCTGTGGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131007109
ATGGCAAGGGATAGCTGCCTCACACGAATTACGGCGGGCTTCGCCATCGGAGGCGCTGTCGGCGGCGCTGTGGGTGCTGTTTATGGAACTTATGATGCTATTAGATCCAAGGTCCCAGGTCTTCTAAAAGTACGGTACATTGGGCAGACGACGGTGGGTAGTGCTGCTGTTTTTGGTCTTTTCCTTGGAGCTGGAAGCTTAATACATTGTGGCAAATCTTATTAG

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057790249.1
MARDSCLTRITAGFAIGGAVGGAVGAVYGTYDAIRSKVPGLLKVRYIGQTTVGSAAVFGLFLGAGSLIHCGKSY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器