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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001198`

染色体: Chr01 坐标: 24128820-24129643 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001198`
名称	SmilChr01G001198
描述	uncharacterized SmilChr01G001198
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	24128820 - 24129643 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131003533`
GeneID	`131003533`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131003533`
原始查询	`SmilChr01G001198`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=46.6; qcov=0.465; evalue=6.57e-16; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=60.8; qcov=0.943; evalue=6.55e-66; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131003533

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057786056.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057786056.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057786056.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057786056.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057786056.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:24129220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:24129244`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr1:24129244`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B94
`Chr1:24129254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B95
`Chr1:24129263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:24129324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B2,C18,C82,D7
`Chr1:24129326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:24129374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B2,C82,D7
`Chr1:24129388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,D11
`Chr1:24129396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:24129403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:24129416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057786056.1

157 aa

157

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 6-156 aa PF13359 DDE_Tnp_4 37-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057786056.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	6	156	5.6e-71	239.1	Plant transposon protein
`XP_057786056.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	37	155	1.6e-05	25.3	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057930073.1
ATGCACGAAGCCCGCCATGGGTTCCCGGGAATGTTGGGGAGCCTAGACTGCATGCATTGGGGATGGAAGAATTGCCCCGTGGCTTGGCATGGCGCCTACACTCGAGGGGATCAAGGCGAGCCAACAATTATATTAGAGGTCGTTGCTTCACAAGATTTGTGGATCTGGCATGCATTCTTTGGAGTCGCTGGGTCCAACAACGACATCAACGTGCTCCACCAGTCCACGCTATTCAACGATGTTTTAGCGGGGCATGAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131003533
ATGCACGAAGCCCGCCATGGGTTCCCGGGAATGTTGGGGAGCCTAGACTGCATGCATTGGGGATGGAAGAATTGCCCCGTGGCTTGGCATGGCGCCTACACTCGAGGGGATCAAGGCGAGCCAACAATTATATTAGAGGTCGTTGCTTCACAAGATTTGTGGATCTGGCATGCATTCTTTGGAGTCGCTGGGTCCAACAACGACATCAACGTGCTCCACCAGTCCACGCTATTCAACGATGTTTTAGCGGGGCATGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057786056.1
MHEARHGFPGMLGSLDCMHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEVVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNDVLAGHEAAVHFLANNSHHTRGYYLTDGIYPDWQVFVKSFQFPNDEKKRRFKVMQEAARNDVERAFGVLQARWDFVAN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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